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我一直在关注Sweave 入门指南，并创建了一个名为 MISC 的新项目文件夹，其中包含一个名为 Sweave 的子文件夹。

我已将示例 .Rnw 文件与 Sweave.sty 文件的副本放在此文件夹中。然后我将我的 R 工作目录更改为 MISC\Sweave。Sweave 确实可以毫无问题地创建 TEX 文件，但随后抱怨：

项目中未设置项目输出文件格式

我已经检查了项目属性，但我无法确定应该在哪里设置它。有任何想法吗？

PS：这是否意味着我必须为我想要 Sweave 的每一个项目进行设置？

我正在成为可重复分析和 Sweave、Beamer 以及特别是 knitr 包的粉丝。

RStudio 允许一键编织和编织文档，但 RStudio 虽然易于安装，但相当不稳定，不具备 Eclipse 的 StatET 插件的成熟度和灵活性。大多数教程或列表服务器在询问有关 knitr 和 RMarkdown 的问题时倾向于参考 RStudio IDE，但是关于如何安装 Markdown 文件并将其转换为.Rmd使用 knitr 包的内容很少。Jeffrey Horner 在宣布 R 降价包时说：

“与 RStudio 合作创建的将 Markdown 文档转换为 HTML。它在其同类最佳的 IDE 中提供了完整的 R Markdown 功能集，但用户可以将 Markdown 集成到他们自己选择的工具链中。”

最后一句话是我一直无法弄清楚的。在其他地方，我看到有人建议使用 knitr 手动编织library(knitr); knit('myfile.Rmd')，但是，在尝试执行此操作时，我收到一个错误：

我能够My file.md使用以下方法将文件转换为 html：

但是，R 代码没有运行，我怀疑我需要先编织.Rmd文件。任何有关如何在 StatET 或 Rstudio 以外的地方编写 markdown 文件的帮助或指导将不胜感激。

我在 Windows 7 Professional 操作系统上使用 R 版本 2.15.1 (2012-06-22)。Eclipse 版本：3.8.0 和 StatET 3.0。

当我尝试在 Eclipse 中运行 r 控制台时，出现此错误：

所以我尝试像这样在 R 控制台中安装：

得到这个错误：

顺便说一句，我的配置是：ubntu 11.10 64bit+eclipse 3.7，我已经关注了这个帖子：http ://www.twm-kd.com/linux/install-oracle-java-sdk-in-ubuntu-11- 10/安装oracle-1.7.0-jdk，然后运行：“sudo R CMD javareconf”，得到：

会话信息

我正在 Eclipse 中开发一个 R 包。虽然我是这个环境的新手，但它很棒。

但我面临的一个问题是，在检查并在 Eclipse 中构建后运行 R CMD install 后，如果我在 Eclipse 的 R 控制台中输入，

Eclipse 仍然显示旧的帮助。我已经尝试过重新启动，重新启动等徒劳无功。如果我在 Windows 中运行 R，它会显示包的正确帮助。我想知道发生了什么事。

我怀疑 Eclipse 有自己的 R 帮助缓存，但找不到如何删除它。

更新如@JimM 的回答所示，您应该选择以下来更新 R 帮助。

"R console View menu" -> R environment -> Index completely

这将需要 2-3 分钟，但我发现没有其他方法可以更新 R 帮助。

当我尝试在 Eclipse 中运行 R 控制台时，出现以下错误：

所以我尝试像这样在 R 控制台中安装它：

并得到这个错误：

我发现在安装 rJava 时使用：install.packages("rJava")会出现类似的错误：

当我运行时sudo R CMD javareconf，我得到了这个输出：

顺便说一下，我的配置是：

当我知道我可以使用 Rcpp 用 C++ 创建一个 R 包时，我很兴奋并且渴望了解它的开发环境。并且感谢Fell Stat Blog，我可以使用 Eclipse 和 StatET（它的 R 插件）快速建立一个良好的环境，以在 Windows 上使用 Rcpp 和 RInside（另一个用于将 R 嵌入到 C++ 应用程序中的包）。

然而，由于该博客是基于 OS X 的，有几件事需要反复试验（几乎放弃）才能适应 Windows——我花了 6 个小时的空闲时间。例如，您需要安装 Rtools 才能使用 R CMD 语句编译 C/C++，并使用 Miktex 将您的 Rd 文件转换为 pdf 文件。此外，构建设置与 OS X 不同。

为了使其他人免于我经历过的可能的试错期，我在 Windows 上的 Eclipse + StatET + Rcpp 上制作了这个 wiki。随意发表评论或其他答案。否则，请享受您可以获得的用于分析软件开发的出色开源环境。

更新（2016 年末）：几年前，我将 R 的 IDE 从 Eclipse 更改为 RStudio，我向所有使用 R 和 Rcpp 的人推荐它。

R 有一个有用的命令（“查看”），它可以让人们在弹出窗口中看到像电子表格一样的表格。我在运行 statET 时在 Eclipse 控制台中使用了这个命令，电子表格弹出了几毫秒然后消失了。

具体来说，我有一个名为“mat”的矩阵，我输入了

有谁知道如何解决这一问题？

我知道这方面有几个帖子，所以如果我违反了礼仪，请道歉。就我而言，我已经尝试了其中的几个，但我似乎无法解决 rj 问题（正确安装它）。

我尝试了 CMD INSTALL 建议并将 tar 文件复制到我的 R 可执行目录

我使用 DOS cmd 窗口运行它，但使用 * 符号失败，所以我通过导航到路径替换了确切的 rj tar 文件名... C:\Program Files\R\R-2.12.1\bin \x64\rj_0.5.0-5.tar.gz 并运行

这似乎有效，因为 R 显示了所有已安装的 Java 包（包括 Rjava）

然而，在 Eclipse 环境中，我仍然收到 rj missing 错误。关于接下来要尝试什么的任何想法？我真的很想让调试功能在这里工作，并为此拉扯我的头发。

哦，即使它显示安装在 R 中。如果我尝试在 R 中启动，我会得到：

• 使用 Eclipse SDK 版本：3.8.0 StatET 3.01.02 rj_0.5.0-5

非常感谢您看一看。这里有一篇以前的帖子，带有相同的错误消息“无法编译简单的 JNI 程序”，解决方案是更新到 R 1.15。但我已经拥有最新版本中的所有内容。虽然它说“查看 config.log 了解详细信息”，但它没有给出位置，并且终端上的“find / -name config.log”什么也不返回。

试图让它发挥作用是一个令人筋疲力尽和令人沮丧的过程。任何帮助都感激不尽。

R 版本 2.15.1，64 位（我使用 Homebrew 安装，但这应该不是问题）

Eclipse 4.2 Cocoa，64 位（也试过 3.7，也没有用）

OSX 10.7.5

这是错误消息：

这是会话信息。

我的设置：Eclipse、 R和Statet

我正在使用 Statet 从 Eclipse 内部使用 R。

我制作了一个图表（这是时间序列的图表，以防这是相关信息）。

我现在希望将此图形保存为 JPG 图像（或 BMP 等...），或将此图像复制到剪贴板中。我需要 PowerPoint 演示文稿中的图表。

有谁知道这是怎么做到的吗？

谢谢