问题标签 [rsqlite]

我已经在我的 Windows 电脑中正确安装了 rpy2，它似乎工作正常。现在我想在 rpy2 中“翻译”一个 R 例程，但是当我尝试加载特定的 R 库时，我在加载 RSQLite 库时遇到了错误。这是错误消息：

由于我成功加载了其他库，因此关于这样的库和 rpy2 似乎是一个特定问题。请问你能帮帮我吗？谢谢

我有一个相对简单的函数来从 sqlite 数据库中提取一些数据：

当我在 R（或 RStudio）中运行此代码时，这对我来说非常好：

但是，我根本没有成功，通过opencpu使用这个函数检索任何数据：

我已经仔细检查了文件是否存在，检查了它的权限，为所有人设置了读/写权限，但一点运气都没有。任何输入将不胜感激。

编辑 1： 尝试了 @Jeroen 对 apparmor 配置建议的更改，但无济于事。将以下行添加到自定义文件中确实有所帮助：

但是，它只帮助我现在得到错误：

RS-DBI 驱动程序：（语句中的错误：数据库已锁定）

通话中： sqliteExecStatement(conn, statement, ...)

这很奇怪，因为当我在 RStudio 中执行完全相同的代码（使用相同的数据库文件）时，我没有收到此错误。

编辑 2：正如 Hadley Wickham ( https://twitter.com/hadleywickham/status/526739851974955008 ) 提出的，我使用 dbGetQuery 简化了函数：

尽管如此，由于我得到完全相同的行为（在 R studio 中工作，发出 curl 命令时给出数据库锁定消息），但无济于事。

编辑 3：实际上它似乎仍然是 AppArmor 问题。我得到：

解决方法：终于找到了。最终这似乎是一个纯粹的 AppArmor 问题。我不得不改变：

至

（注意 k）以允许文件锁定。

我真的被困在这里了。我在 Mac OSX 上创建了一个 SQLite 数据库，现在正尝试在 Windows 上将数据插入其中。我正在使用 RSQLite 库在两个平台上的 R 中进行操作。

我正在尝试从数据框中插入数据x：

我尝试以下步骤并收到以下错误消息：

更新：vaettchen 下面的建议使用带有 append=TRUE 的 dbWriteTable 有效，谢谢。但是，dbSendQuery 仍然存在问题，在尝试删除 id=74 的所有条目时，请参阅下面的错误：

感谢任何帮助，它可能只是我看不到的愚蠢的东西。非常感谢。

我有一个 sqlite 数据库，我需要将空间信息与元数据一起插入到 R*tree 和随附的常规表中。每个条目都需要在数据库的生命周期内唯一定义。因此，常规表有一个 INTEGER PRIMARY KEY AUTOINCREMENT 列，我的计划是从插入该表开始，提取最后插入的 rowid 并将它们用于插入 R*tree。唉，这似乎不可能：

似乎只保留了最后插入的 rowid（可能出于性能原因）。由于要插入的记录数是几十万，逐行插入是不可行的。

所以问题是：有什么方法可以让last_insert_rowid()我屈服于我的意志？如果不是，最好的故障安全替代方案是什么？一些可能性：

• 在插入之前记录最高的rowid和'SELECT rowid FROM testTable WHERE rowid > prevRowid'
• 获取要插入的行数，获取 last_insert_rowid() 并使用seq(to=lastRowid, length.out=nInserts)

虽然以上两个建议至少在直觉上应该有效，但我对 sqlite 没有足够的信心知道它们是否是故障安全的。

我有一个包含 R*tree 虚拟表的 SQLite 数据库。这张桌子的行为相当奇怪，我不知道出了什么问题。我将不胜感激任何指向我可以调查的方面！

好像还好...

R*tree 表的一般外观

scanEnd 的边界

到目前为止，一切都很好...

记录在哪里？

当比较器达到任意大的数字时，其他列也会发生同样的情况。此行为仅存在于 R*tree 表中 - 常规表工作正常...

我是否偶然发现了我不知道的 R*tree 模块中的约束？R*tree 中的所有记录都来自一个大插入，我没有触及 R*tree 所依赖的基础表......

编辑： 应 CL 的要求，我尝试创建一个可重现的示例。至少在我的系统上，以下会产生具有相同行为的 R*tree：

编辑 2： 可以从以下链接下载使用第一次编辑中给出的命令创建的数据库： https ://dl.dropboxusercontent.com/u/2323585/testdb.sqlite

我有这个用来加载 SQLite 表的函数

但是现在它接缝会产生错误

（我从这里下载了数据库）

这是我的功能的错误还是问题？

我正在使用 RSQLite 来组合两个表。我检查了每一步，但仍然没有弄清楚出了什么问题。这是我的脚本：

我正在使用一个 SQLite 数据库（1GB+），其中只有一个堆叠的金融刻度时间序列表。我正在使用 RSQLite 包连接到数据库。我的情况很简单：选择从一个日期到另一个日期的数据子集，例如 from 20140101to 20140930。因此查询也很简单：

数据存储在 SSD 上，但读取时间看起来仍然很慢。是否有一些方法或技巧可以提高这种简单子集查询的性能？

该数据库有 14 列并自动索引。

我想发表以下声明：

此语句适用于SQLite Manager，但不适用于RSQLite。

请你帮助我好吗？

非常感谢 ：）

我正在使用此代码将数据从 DB 加载ontime到 R 中的数据框中。

但是，似乎 R 找不到ontime我从 SQLite shell 创建的数据库。

我试图ontime在磁盘上搜索，但没有找到。我还使用select * from ontime命令仔细检查了该数据库是否存在。那么，这个数据库存储在磁盘上的什么位置，我该如何找到它呢？