问题标签 [rsqlite]

我正在使用RSQLiteR in 中的库来管理对于 RAM 来说太大的数据集。对于每个回归，我都会查询数据库以一次检索一个会计年度。现在我有硬编码的财政年度：

我想让财政年度（以上 2008 年）使更改更容易（并且万无一失）。有没有办法可以将变量传递给 SQL 查询字符串？我很想使用：

我正在使用 RSQLite 包进行数据库操作。为了从表中选择数据，我使用了以下代码，但我只有 500 行。实际上，该表包含该查询的 1200 多行。这个问题的原因是什么？

我一直无法找到有关 RSQLite 如何处理因素的文档。通过快速测试（见下文），看起来它们已转换为字符。

问题1：有没有办法将它们保存为因子？我可以想到一些笨拙的方法（主要涉及.Rdata存储因子级别的单独表或文件），但似乎应该有一个标准并且因此更易于维护的方法来执行此操作。

问题2：如果不是RSQLite，比其他一些数据库或类似数据库的包？我在这里的用例很简单：在处理每个大的（2-5mm 行 X 550 列）data.frames 以构建一个巨大的数据库时附加一堆，然后只能从该数据库中选择我想要的行带来进入data.table并继续工作。

是否有一些简单的方法，无论是在 SQL 端还是在 R 端，将 data.frame 附加到具有更多列的现有表？缺少的列应该只用 NA 填充。如果它优雅地处理表 2 的列比表 1 多，那么会加分吗？

我也可以为此设想一个包装器。该算法看起来像：

1. 从现有 SQL 表中读取 1 行。
2. 从该读取中获取列名。
3. 使用未包含的名称将列名称添加到 data.frame；填补缺失。
4. dbWriteTable 现在 data.frame 具有与 SQL 表相同的列。

SQLite 具有可变类这一事实简化了这一点。但如果它已经存在，我宁愿不重新发明轮子。

编辑

只是需要澄清一下：这些数据集很大。SQL 数据库大约 30GB，而 data.frame（实际上是data.table出于显而易见的原因）大约 4GB。因此，需要将 SQL 表读入 R 的解决方案是行不通的。

另一种算法是在 SQL 中执行：

1. 将 R data.frame 写入临时 SQL 表。
2. SQL 魔术将该表附加到主 SQL 表上。
3. 删除临时 SQL 表。
4. 利润。

有没有一种方法可以使用 RSQLite 将 R 数据框中的日期存储为 SQLite 中的字符串？目前，日期列存储为整数。在写入 SQLite 之前，我可能可以将所有日期转换为字符串，但是由于我需要从数据框是参数之一的函数写入 SQLite，因此我希望避免这种转换。

我正在尝试将 RSQLite 包添加到 Imports 而不是 Depends 在我的包中。在描述中我有：

在命名空间中有：

但是当我加载我的包时它失败了：

这将导致示例失败，因为dbDriver方法是由 导出的RSQLite，但未RSQLite加载命名空间。我试过添加@importMethodsFrom RSQLite dbDriver，但结果是一样的。

接下来我应该尝试什么？

我最近开始使用 SQLite 来存储我的原始生物数据（我有几种形式的原始数据输出，发现它是查询和链接与同一试验相关的表的一种非常有用的方法）。我现在想从不同文件中提取原始数据，将其组合成一个数据框，然后对其进行处理（例如，我想将我的日期转换为朱利安日期并根据我已有的变量创建新变量）。

此链接提供了一个很好的示例，说明了如何组合同一数据库中的文件：

将扩展名为 .sqlite 的文件导入 R

我设法用它来创建我想要的数据框。但是（这里是我缺乏经验的地方）生成的数据框没有可识别的标题：

如果有人能指出我的错误，我将不胜感激。我确实尝试添加 header=T 并且代码运行但我仍然无法访问名称：

for (i in seq(along=tables.excl)) { + DataFrames[[i]] <- dbGetQuery(conn=con, statement=paste("SELECT * FROM '", tables.excl[[i]], " '", sep="",header=T)) + } 名称(DataFrames) NULL

我确实尝试过谷歌搜索，但没有走得很远 - 也许我正在搜索错误的术语？

非常感谢

我正在尝试通过 SQLite 包连接到服务器，但在任何地方都找不到正确的数据库凭据拼写。实际上我在服务器上有 MySQL 和 PostgreSQL 基础，我找到了一种连接到 PostgreSQL 的方法，听起来像这样：

但如果我将驱动程序更改为 ('SQLite') 和数据库凭据，它会显示：

有人知道 MySQL 数据库连接的正确参数是什么吗？

尝试dbWriteTable与RSQLite驱动程序一起使用会导致以下错误：

我的 R 脚本：

我正在尝试使用较小的 data.frame 重新创建此错误，但不能...（这使得分类变得更加困难）

如果我Con <- dbConnect(SQLite(), dbname="fake.db")改为Con <- dbConnect(SQLite(force.reload=T), dbname="fake.db")我得到：

我在运行 R 3.02 的 Windows 7 上

我有一个到数据库文件的 SQLite 数据库连接。我想从其中一个表中提取一些数据，在 R 中进行一些处理，然后从处理过的数据在同一连接上创建一个临时表。它需要是一个临时表，因为用户可能没有对数据库的写入权限，但我希望能够在数据库中已有的数据旁边查询这些新数据。

所以，例如：

然后我想在连接中创建一个临时db表d

我知道我可以这样做：

但我需要在临时表中使用它，并且在dbWriteTable.

我想到的一种解决方法是添加一个临时表，然后添加列并更新它们：

但是我无法从d列中获取数据：

我想，即使我让这个工作，它也会非常低效。

我认为使用 read.csv.sql 可能有某种方法可以做到这一点，但这似乎不适用于打开的连接对象。