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我可以使用以下 R 脚本成功连接到本地 MySQL 服务器：

但是，我不希望我的密码出现在脚本中，因为它将保存在文件中！我正在使用 Ubuntu 13.10、MySQL 5.5.35、MySQL Workbench 6.0 和 R 3.0.1。

在工作中，我使用 Windows，并且可以使用以下行连接到无需密码即可访问的 SQL Server：

在这种情况下，似乎我以有权访问服务器的员工身份登录就足够了。

我想完成与此类似的事情 - 如何使用我的 Ubuntu 计算机连接到本地 MySQL 服务器？

我已经在 CENTOS 6.5 上成功安装了 InifiniDB。InfiniDB 是与 MySQL“兼容”的柱状数据库（相同的端口等：我什至设法安装了最新版本的 MySQLWorkbench，并且与 InifiniDB 一起工作很有魅力 - 相信只需处理另一个安装的 MySQL）。

安装没有 MySQL，因为我不需要它:)

我尝试从 RStudio Server 安装 RMySQL，但无法安装：安装程序希望在某处找到 MySQL 的副本，但我没有。

请参阅下面的安装日志。我将 :/usr/local/Calpont/mysql/bin 放在我的 PATH 中，但这没有任何效果。

请考虑到这个灵感来自 InfiniDB 本身：见这里http://infinidb.co/system/files/Calpont%20InfiniDB_Quick%20Start_for%20R.pdf 我猜主要问题，比较错误和 InfiniDB 论文，是他们建议创建以下全局变量：

但是我在 CENTOS 上的安装在 /usr/include/mysql/ 没有 mysql 文件夹。

有什么建议么？

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我的函数包含在一个更大的函数中，使用dbConnect()、dbGetQuery()和dbDisconnect()。

当函数出错时，我修复它并尝试重新运行它。我无法重新运行它，因为我得到： Error in mysqlCloseConnection(conn, ...) : connection has pending rows (close open results set first)

（注 1：我没有使用dbSendQuery()+ fetch()，只是dbGetQuery()，所以这本身就是一个奇怪的错误。）
（注 2：错误不会出现在RMySQL代码中；它们出现在 R 代码的其他部分。）

失败的解决方案1：dbClearResult(dbListResults(myconnection)[[1]])不起作用，因为myconnection是在函数环境中创建的。

失败的解决方案 2：lapply( dbListConnections( dbDriver( drv = "MySQL")), dbDisconnect)错误输出与上面相同的“待处理行”错误消息。

我现在唯一的解决方案是杀死 R 并重新开始。但是，我知道 SQL 数据库中仍然存在连接（因为我的老板告诉我这样），所以我正在寻找一个适当的解决方案来关闭结果/连接。

谢谢你的帮助。

您好，我想知道如何在 R 中合并 2 个数据帧，有一个合并功能，但我想这样做：

我的想法是我必须同步 3 个 csv 文件（数据帧），我不知道如何与 R 同步。

如果有人对此有任何想法，谢谢

我重新编辑我的帖子我希望我的合并数据框是这样的：

数据框1

我正在尝试使用 R Shiny 开发仪表板，它从 MySQL 数据库中提取数据并以图形形式表示。我需要使用多个数据创建一个时间序列。但是当 MySQL 中的时间戳值无法转换为时间序列中的日期时间值时，就会出现问题。以下是我的server.R代码：

表的输出将如下所示

谁能告诉我为什么我不能用这些数据库值创建一个时间序列？

所以我对使用 r-studio 比较陌生，而且我在安装 RMySQL 时遇到了问题。

我正在运行 RStudio 0.98.501 和 R 3.0.2 并尝试将 R 连接到数据库。但是，每当我尝试安装 RMySQL 时，都会收到错误消息“package 'RMySQL' is not available (for R version 3.0.2)”。当我搜索时，我发现了这个线程：http ://r.789695.n4.nabble.com/RMySQL-with-Windows-7-td4684805.html ，它解释了我如何将包下载到程序文件。我使用 .libPaths() 函数进行了检查，并确认了这一点（“C:/Program Files/R/R-3.0.2/library”）。我想我的问题是如何更改库路径以便我可以安装 RMySQL？还是我对这一切都错了？

R版3.0.2 (2013-09-25)
平台：x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)

从那以后我就一直在使用 RMySQL，最近我格式化了我的计算机，现在
尝试再次安装 RMySQL。
但是这一次，我将 MySQL Server 安装在其他硬盘上，而不是C:\
我所知道的一切，之前安装 RMySQL 时的事情，
我在 R-studio 控制台上得到了这样的结果。

...

...

（对不起，如果这是非常基本的，我只是无法弄清楚）

我有一个表 t 坐在一个 mysql 数据库中，它看起来像这样：（名称是主键）

数据库中的当前表

我在 R 中也有一个 data.frame，反映了余额的变化

R中的data.frame

我想执行相当于 mysql replace的操作，以便更新我的表以反映新余额

数据库中的所需表

我目前正在使用 RMySQL 包 - 我尝试使用 dbWriteTable 执行此操作，但无法使其正常工作。

Eg1（“插入”）

生产

Eg2（“覆盖”）

生产

我该如何更换？

我对 R（一般的计算机编程）非常陌生，并且正在从事生物信息学项目。我创建了一个 MySQL 数据库，并使用 RMySQL 连接到 R 中 MySQL 服务器中的该数据库。从这里我发出查询以从表中选择某个字段，获取此数据并将其放入 R 中的数据框，如下所示：

我的前 2 个数据帧是整数，我的第三个数据帧是十进制格式。我可以对这些数据框进行简单的相关性测试，但无法运行详细的测试（或绘图），如下所示。

因此，我使用通常的列表索引设备 $ 访问了这些数据帧中的数据，但是如下所述，十进制数据帧不起作用。

通过这样做，我能够在前两个数据帧上执行 spearman 等级相关测试和散点图，但不能在十进制数据帧上执行。关于我需要做什么的任何建议？我确信答案很简单，但我找不到这个简单任务所需的编码。任何帮助将非常感激。

与我的问题相关的系统信息：

我在上述 AWS Linux AMI 上安装了 R。我正在尝试将运行 MySQL 的 RDS 实例中的数据提取到 R 数据帧中。

就目前而言，我已将 DBI 包安装到 R 中，但安装 RMySQL 失败并出现以下错误：

很明显，我需要将安装定向到安装 MySQL 的位置，但我不知道从哪里开始找到正确的目录。我做了以下尝试环顾四周：

所以我的 AWS Linux 实例上有很多不同的 MySQL 目录。我在安装路径中使用哪一个？我应该反复试验吗？

我的另一个问题是（假设我正确安装了 RMySQL），MySQL 服务器是否必须在安装了 R 的同一物理（虚拟？）机器上运行才能使 RMySQL 工作？

其他研究表明，必须创建 SSH 隧道才能使 RMySQL 连接到 MySQL 数据库才能正常工作。这是真的？如果我没记错的话，AWS RDS 不允许 SSH 隧道。

还有其他建议吗？