我有一个从 Rstudio 运行时完美运行的 R 脚本。它使用一个.Renviron文件来提供可见的环境变量Sys.getenv()（所以我知道它有效）。

但是，当我通过 powershell 运行完全相同的脚本时，R 脚本神秘地找不到那些环境变量（我证实了这一点print(Sys.getenv())- 通过提供的环境变量.Renviron无处可见。

问题

为什么.Renviron从 powershell 运行 R 脚本时找不到变量（而不是在 RStudiom 中运行脚本时，一切正常）

我试过的

该.Renviron文件当前保存在"C:/Users/Administrator/Documents/.Renviron"

检查normalizePath(Sys.getenv('R_HOME'))退货"C:\\Program Files\\R\\R-3.6.0"，所以我也尝试放在.Renviron那里。没运气

基于此，我也尝试过Sys.getenv("C:/Users/Administrator/Documents/.Renviron")，但再次没有运气

首先，我知道以下讨论涉及同一主题。但是，按照说明，我仍然可以不更改临时目录。

我为本地用户安装了 Anaconda，然后安装了 R。当我尝试启动 R 时，出现以下错误

问题似乎是 /tmp 中没有可用空间。不幸的是，我需要管理权限来分配更多空间或删除 Rtmp 文件。

我遵循了其他讨论的一些答案，并将我的 Renviron 文件中的 TMPDIR 路径更改为本地文件夹。但是，这似乎被忽略了，因为我得到了完全相同的错误。我的 Renviron 文件如下所示：

，我用“user_name”替换我的实际用户名。我实际上很惊讶我的临时目录是根目录而不是在我的用户下。如果有人知道我的方法有什么问题，我将非常感谢一些帮助。

在 Windows 7 中，我的 .Rprofile 位于自定义位置（不是R_HOME，不是HOME）。R_ENVIRON_USER我通过指向该位置的用户环境变量通知操作系统该位置。其他任何地方都没有其他 .Rprofile。

在 RStudio 中，我将默认工作目录（不在项目中时）设置为同一位置

当不在项目中时，.Rprofile 的来源是正确的。但是，在另一个项目中或创建新项目时，.Rprofile不是 source。

我如何确保我的 .RProfile 即使在项目内部也有正确的来源（假设项目目录中没有特定于项目的 .RProfile）？我认为环境变量会解决这个问题。

回答和更新

我必须设置环境变量R_PROFILE_USER并提供 .Rprofile 的完整路径和文件名。在命令提示符下，我输入：

SETX R_PROFILE_USER "C:\Users\tspeidel\OneDrive\.Rprofile"

我真的遇到了 RStudio 的问题。几天前它一直运行良好。然后它说我需要最新版本的 RTools。我试图安装它，但不认为它成功。但是现在我无法在 R 中加载任何内容。在启动 RStudio 时，我收到以下消息：

我已经查找了这个问题的解决方案，人们说要删除 /Renviron 但我不知道这会不会更糟。

以下是我在 R 中输入的一些结果：

我真的不明白出了什么问题。任何人都可以帮忙吗？

如果它是重复的，我很抱歉，但是我已经阅读了很多线程，但没有一个有效，
只有少数与 R 相关。

我想使用github actions. 所以这样做我需要传递一些密钥、令牌等。
但是我想在我的回购仍然公开的时候将它们隐藏起来。到目前为止我所做的是：

git add -A（.gitignore 不包括 .Renviron）
git commit -m 'message'
git push
（现在可以使用，但我的 .Renviron 仍然可见）
git add .gitignore（在 .gitignore 中添加 .Renviron，而 .Renviron 在 github 存储库中）
git commit -m 'message'
git push
（现在可以使用，但 .Renviron 仍然公开可见）
然后
git rm .Renviron
git commit -m 'message'
git push
（这一次您可以想象找不到所需的环境对象。）

任何帮助表示赞赏。我觉得有点接近解决方案，但我做错了什么或
错过了什么

我试图了解文件 .Renviron 和 .Rprofile 的使用。如果我理解正确的话，.Rprofile是一种启动脚本，来源于 R 代码，它设置用户可能一直需要的选项和环境变量，或者用于特定项目。另一方面，.Renviron在 .Rproject 之前加载，并且仅定义环境变量。

根据设计，我知道 R 将加载用户或项目级别的 .Renviron 和 .Rprofile 文件，但它不会同时加载用户和项目级别的文件。本质上，R 只会加载项目特定的 .Rprofile 和 .Renviron 文件，前提是它们已定义。也就是说，将一些库和函数放在用户级别 .Rprofile 中是谨慎的，因为我几乎一直都需要它（例如，我经常使用dplyr语法），同时我想加载特定于项目的库和函数。

.Renviron 文件的目的对我来说更加难以捉摸。据我了解，它的目的是存储环境变量，比如密码、API 密钥等。但是，我也可以使用 .Rprofile 在 .Rprofile 中设置环境变量Sys.setenv()。例如，我在项目的 .Rprofile 中设置了环境变量，以便将并行化与以下包一起使用：

由于 .Renviron 不使用代码，我的假设是我可以使用以下语法将此行放入 .Renviron 文件中：

但是，我发现关于如何在 .Renviron 中设置环境变量的有用信息很少，以及在这里放什么是可取的。

因此，我的问题是：

1. 在项目中工作时，如何同时加载用户和项目级别的 .Renviron 和 .Rproject 文件？
2. 我通常会在 .Renviron 中放入哪些环境变量？（任何关于如何设置变量的列表或教程将不胜感激。）
3. 在哪些情况下，建议将环境变量添加到 .Renviron 而不是Sys.setenv()在 .Rprofile 中使用，反之亦然？