问题标签 [pystan]

我已经安装了 python 3.7 并想使用 fbprophet ( https://facebook.github.io/prophet/docs/installation.html#python )进行一些预测

但是在使用命令安装软件包时出现此错误（pip install fbprophet）

我做了一些研究，并知道这可以通过 conda 实现。但我正在寻找不使用 conda 的解决方案。

提前致谢。

我有一个依赖 pystan（用于 fbprophet）的 python 项目。作为 CI/CD 工作流程的一部分，我正在尝试设置 jenkins 来构建图像并推送到 docker 注册表。但是pystan的pip安装超级慢。似乎在这个阶段停留了 10 多分钟：

每当我尝试构建图像时，詹金斯似乎对 t2.medium 没有响应。

还有另一种安装pystan的方法吗？事先下载轮子？我怎样才能弄清楚是什么让它这么慢？

我可能会从一个已经安装了 pystan 的基础 docker 镜像开始？

我想在 Windows 64 位上使用用于 python的库fbprophet 。它取决于pystan，它很难在 Windows 上安装（在 Linux 上，一个简单的“pip install pystan”就足够了）。在文档中，他们解释了如何在conda环境中安装它，这要归功于通过 conda 安装的 mingw 编译器。

我真的需要在标准（非conda）环境中从 pip 安装它，所以我想知道如何从我的 conda 环境中构建一个轮子，以便将它安装到我的正常环境中。

我尝试（在 conda env 中）这样做：

它创建了 3 个文件：

• Cython-0.29.15-cp37-cp37m-win_amd64.whl
• numpy-1.18.1-cp37-cp37m-win_amd64.whl
• pystan-2.19.1.1-cp37-cp37m-win_amd64.whl

但在正常环境中，“pip install pystan-2.19.1.1-cp37-cp37m-win_amd64.whl”不起作用。

它说它是成功的：

但是当我尝试导入它时，我得到了同样的错误：

这与我在 Windows 上直接从 Pypi 安装（“pip install pystan”）时遇到的错误相同。我想我在构建轮子时做错了什么，实际上我看不到构建的 DLL 在哪里，无论是在轮子中还是在 conda 环境目录中。

一些 Python Wheel 专家可以帮助我吗？:-)

我已经开发了使用 R 包 brms 估计模型的管道，现在我需要将其转换为 python。我知道我可以在 python 中最接近 brms 的是 pystan，我必须使用 Stan 语法编写我的模型。我想知道是否有一个 brms 函数可以生成 Stan 代码，该代码可以用作 python 中 pystan.StanModel 函数的 model_code 参数。我曾尝试使用 make_stancode 函数生成的代码，但没有奏效。

这是 make_stancode 生成的代码：

这是我在 python 中使用的代码：

这是我收到的错误：

“运行时错误：异常：在上下文中声明和发现的数字维度不匹配；处理阶段=数据初始化；变量名=Jmo；声明的暗淡=（1）；发现暗淡=（）（在第24行的'未知文件名'中）”

感谢所有的帮助

我在 Windows 10 上安装 fbprophet 时遇到问题，我不确定问题实际上出在 pystan 还是 fbprophet 上。一旦安装开始它就会继续进行图片
有没有人遇到过类似的问题并设法解决它？

我需要使用生成的数量块扩展以下模型，但我不知道该怎么做：

我对以下内容进行了以下更改stan_code：

但是我在编译时不断出错，更不用说运行模型了。

第一次使用斯坦。 我从 Coursera 课程中找到的一个示例开始，他们正在使用我试图在 Stan 中重新实现的 JAGS。课程免费旁听，我已链接相关讲座。

模型背景：

（我不知道如何使用 LaTeX，所以我会尽可能地对其进行格式化）：
该模型是一个混合模型，其中输入是具有潜在类n的实数向量。2他们假设这些类是Z_1 ~ N(mu_1, stdev)and Z_2 ~ N(mu_2, stdev)（它是 2 个 Normals 的混合，具有不同mu的 's 但相同stdev）。他们假设一个统一的 Dirichlect 先验与 alpha=1在每个类别中的概率。

每个数据点都是从基于概率向量的分类分布中提取的，它们使用相应的正态似然增加似然性。

我的代码

当我使用选项 1 时出现错误，

这是有道理的，因为分类的输出是一个 int。

但是，当我做有意义的事情并将 z 定义为整数向量时，正如我在 Stan 备忘单中看到的那样，我得到了一个不同的错误（选项 2）

我在 Windows 和 Linux 环境中都使用 python 3.6。我无法在 Linux 上使用 pystan 2.18.1.0 在 Linux 上运行先知模型，但我只能在具有该版本的 Windows 上运行它。我将训练好的模型保存到 Pickle 文件中。谁能帮我回答为什么 Linux 中的 pickle 文件大小比 Windows 大 10.x？我认为这可能是编译器问题，并在 Linux 服务器上升级了我的 GCC 编译器，但仍未破解。

环境细节：Windows：pystan 2.18.1.0 python3.6 fbprophet 0.6

Linux：pystan 2.19.1.1 python3.6 fbprophet 0.6

运行以下行后（已经存在包）：

我执行以下操作：

我收到以下错误：

我正在使用 python 3.6 和 pip。我正在使用标志 -vvv 来更详细地帮助调试错误。

在我的 ubuntu 中，当我要使用 pip3 命令安装pystan和fbprophet时表现不佳。所以，我的系统挂得很严重。我尝试了这么多逻辑仍然有错误，请指导我如何纠正这个问题？