问题标签 [pyimagej]

我想使用 ImageJ 和它的一些宏，并从 jupyter 笔记本中调用它们。我知道PyimageJ，并且我已经能够安装它并使用 ImageJ 方法加载要显示的图像。但是我在掌握如何调用和运行 imageJ 附带的基于 java 的插件或加载用户编写的宏时遇到了一些困难。

我一直在看这个例子：https ://omero-guides.readthedocs.io/en/latest/fiji/docs/imagej_python.html

有问题的示例实际上是针对Omero的，我不需要也无法访问（需要注册 Omero）。

我想我对跨不同平台工作缺乏更横向的理解，有人可以帮帮我吗？

提前谢谢了。

我安装了pyimagej：

安装后，我创建了一个 conda imagej 环境。

在我的 pycharm IDE 中，我在 imagej 环境中设置了正确的 python 解释器。

我的脚本开始于：

它给了我错误

ModuleNotFoundError：没有名为“ij”的模块

我不明白，因为 python 解释器中肯定有包 pyimage 。

感谢帮助！

同样的问题已经在这里发布： https ://forum.image.sc/t/cannot-find-imagej-module-after-installing-pyimagej-with-conda/23190/5 但没有解决方案。

阅读此图像后，我想使用 pyimagej 绘制直方图。

如何从 pyimagej 访问 FileSaver？

我在网上看到的一切都是这样的：

但是对于 pyimagej，我们加载它的方式不同：

.FileSaverij.io()也不存在

谢谢

使用 conda 的安装很简单，没有错误。安装指南中没有提到将新创建的 pyimagej 环境二进制路径添加到 $PATH 的额外步骤，以便 Jupyterlab 可以找到它。但是然后像这样测试安装

发生错误

经过一番搜索，似乎名为 maven 的东西找不到它的依赖项之一。

错误消息中提到的 pom.xml 文件的内容。

有人可以告诉我如何找出可能丢失或找不到的东西。