问题标签 [package-development]

我在Mac下开发了一个包，想分发给我的同事。我可以在 Mac 下构建包，也可以在 Mac 和“大多数”同事的 Windows PC 下安装它。其中一些是 Windows 7，一些是 Windows 8。它们都使用 RStudio 和 3.1 以上的不同 R 版本。

我现在有一台电脑的一个大问题，不知道该怎么做。

当我尝试安装软件包时，我收到以下消息

我现在复制了完整的包源，所以所有文件夹和文件，到 Windows 机器，在那里安装了 Rtools 和 devtools 并在 Windows 机器上构建了同样问题的包......

有没有办法获得更精确的错误信息，而不仅仅是状态信息？我没有更多的想法。

我也感觉到我的文件赢得了建设者。它没有报告错误消息，但我也没有从网站上获得“新构建包”。

希望你们中的一些人有一些建议。提前致谢！

编辑：

在开始时将路径更改为没有 \\ 的内容并尝试删除所有其他错误消息后，我收到了以下消息：

在这之间，我取得了部分成功，但仍然无法安装该软件包。这是介于两者之间的输出：

我有一个类似但不同的问题，当我的 ggplot2 语法合理时，如何处理 R CMD 检查“全局变量没有可见绑定”注释？.

在那种情况下，通过使用 aes_string 而不是 aes，一切都可以顺利进行。但是，这对于 plyr afaik 是不可能的。

例如，当我通过 ddply 引用数据框中的列名时，就会出现问题。

这段代码是完全有效和理智的，即使我理解注释的使用，它们仍然会混淆输出窗口中的其他消息，使包开发成为一种痛苦，实际上迫使开发人员忽略注释。

摆脱这些笔记的正确方法是什么？或者，以 R CMD check 接受而不给出 NOTE 的方式编写代码的正确方法是什么？

最好的，迈克尔

我正在制作一个包，为引导程序提供一些额外的 ui 组件。我选择依赖（很棒的）nemo64:bootstrap包来获取 LESS 引导库。

我的包必须提供额外的 LESS 文件，这些文件需要一些引导 LESS 变量（比如@brand-success）。最终用户很可能已经自定义了这些变量。

nemo64 :bootstrap包提供了一个custom.bootstrap.import.less包含引导变量的文件 ( ) 供用户在需要的地方包含它。它也是期望用户自定义其引导程序的地方。所以我想将它包含在我的包的 less 文件中，但我不知道，从我的包中，最终用户将把这个文件放在哪里。

我可以假设给出的默认路径在nemo64:bootstrap包文档 ( /client/lib/custom.bootstrap.import.less) 上有一个示例，但是如果另一个包编写者做出不同的选择，这些包将不兼容。

有没有办法不对最终用户强制执行特定的文件架构？

我尝试hyperSpec使用 Windows Vista 构建 R 包。当我这样做时，我收到以下错误消息：

无论我使用命令行R CMD build还是 R Studio 的构建工具（安装了 RTools，安装了所有包依赖项），都是一样的。

为了解决这个问题，我尝试更改临时目录的路径或手动设置文件夹的权限，但没有成功。我试图以管理员身份执行所有操作，但再次没有成功。

我认为，这里讨论了一个类似的问题：

https://stat.ethz.ch/pipermail/r-devel/2013-April/066389.html

然而，没有针对这个问题提供解决方案。

另外，当我尝试用Win7构建包时，我也遇到了同样的问题。

我正在编写一个我一直使用的函数包，其中一个基本上是一个简短的包装器setdiff：

所以1:6 %\% 4:6 == 1:3。

记录这似乎是一场斗争。以下是我的my_package-infix.Rd文件中引发问题的相关部分：

当我运行时，R CMD check my_package_0.1.0.tar.gz我收到警告：

暗示这可能意味着我需要更多的逃避，我试图调整这些行：

但是产生的令人沮丧的警告是：

所以现在我们已经从一个未转义的反斜杠变成了两个反斜杠。有些东西没有加起来......什么给了？.Rd解析手册（2.2.1）的相关部分没有提供太多帮助：

反斜杠 \ 用作转义字符：\\、\%、\{ 和 \} 删除第二个字符的特殊含义。解析器将删除初始反斜杠，并将另一个字符作为文本的一部分返回。反斜杠也用作标记宏的初始字符。在类似 R 或 LaTeX 的上下文中，反斜杠后跟字母字符开始宏；宏名称一直持续到第一个非字母数字字符。如果无法识别名称，解析器会删除末尾的所有数字，然后重试。如果仍然无法识别，则将其作为 UNKNOWN 令牌返回。反斜杠的所有其他用途都是允许的，并由解析器作为文本传递。

它似乎编译得很好——R CMD build并且R CMD INSTALL没有给出任何错误，当我运行时library(my_package)，我可以运行?"%\\%"以调出正确的手册页，我正在使用的地方，正如预期的那样（当我在andA %\% B中只使用一个转义时）。aliasusage

我见过其他一些人为此苦苦挣扎，但没有解决方案，例如here 和here，后者由Yihui Xie（knitr其他软件包的开发人员）开发。

（PS 中间甚至没有偶数build个反斜杠，因为这意味着百分号不会被转义并被%解释为.Rd文件中的注释字符）

编辑：我已经更接近于破解坚果（似乎）。

查看解析器手册的表 1-3 （第 5-7 页），我们可以看到发送到的文本以usage“R-like”方式解释，而 toalias被解释为“逐字”。我不确定这到底是什么意思（尽管第 8-9 页有描述），但R CMD check如果我使用以下内容，我会少些刻薄：

现在只有一个警告：

我正在使用devtoolsRStudio 在本地开发一个包。修改函数后，当我尝试从项目中调用它时，R 继续使用旧版本的函数。

我的工作流程是：

• 修改函数并保存
• 称呼Build & Reload
• 使用包开发项目中的一些示例代码测试该功能（Build & Reload之后我经常运行另一个）
• 转到我要在其中使用该功能的项目
• 称呼library(my_library)

但是我刚刚做的修改不会有效。这个工作流程有什么问题？

我找到了这篇关于如何在 R 中自动更新包版本号的文章（原文）。

我想以与他们建议的方式相同的方式实现它，但我当时无法创建自己Makefile的包来构建包。

他们提供的功能运行良好。

谁能帮我创建一个Makefile检查，构建，如果两者都成功增加版本号，在新版本号下构建。在 RStudio 中，可以选择Makefile作为构建工具。

一般来说，我喜欢让所有开发包都带有第 4 个版本号，例如0.1.2.9001. 目前我总是覆盖我的包，只手动设置三个数字，比如0.1.3.

更新

我已经完成了这个包，它在https://github.com/iembry-USGS/ie2misc在线托管。

由于原始帖子中的错误消息没有帮助，我尝试对包进行 roxygenize 以查看它是否有效。以下是命令和错误消息。

我假设意外的输入是指一个字符，但我不知道哪个文件包含有问题的字符。

任何帮助都会有所帮助。

谢谢你。

更新结束

我正在创建一个包含 3 个函数的包。我已经成功地使用 1 个函数创建了 3 个其他包，但没有使用这个包。

我在下面包含了DESCRIPTION文件的内容。该内容下方是我在尝试记录此包时收到的代码和错误。

谢谢你。

然后我运行：

编辑：

是否有可能~/.Rprofile没有加载在check(). 看起来我的整个过程都失败了，因为~/.Rprofile没有加载。

完成编辑

我在使用testthat. 实际上，当我测试我的包时test()一切正常。但是当我测试时，check()我收到一条错误消息。

错误消息说：

在此错误之前，我获取了一个定义subfolder_prefix变量的脚本，我想这就是它在这种test()情况下工作的原因。但我希望它也能在check()函数中运行。

我会把完整的测试脚本贴在这里，希望不要太复杂：

在我的脚本中，我定义了变量subfolder_prefix <- 'IC_'，并在测试中检查是否为每个原始文件创建了相同数量的文件夹......这就是我的脚本应该做的......

所以正如我所说，我不确定如何在这里调试这个问题，因为test()工作但check()在运行测试期间失败。

在为一个项目构建了一个包之后，我们意识到按照Laravel 5 包开发清晰度做我们需要实现的事情存在一些问题

也许我宁愿解释我的目标，有人可以建议前进的方向。

我们已经构建了一个现在需要“重用”的 Laravel 5 应用程序。

我们不得不修改 Laravel 并实现一个 Eloquent 类型的基本模型，因为我们的数据源实际上是 C# Web 服务。此时，将对数据库进行调用，我们拦截它并对 SOAP 进行“API”调用。

主要区别在于 CSS，可能是一些 JS 和内容，但所有的路由/控制器/模型在所有项目中都将保持不变。大多数配置来自端点。

最初，我们考虑为每个站点的样式创建多个资产存储库，并拥有一个基础存储库，这是包含的核心 Laravel 项目。这似乎变得相当复杂，因为由于分支和多目录问题，我们不能简单地在 repo 中有一个 repo。

然后我们开始尝试将“核心”构建为 Laravel 包的想法，但我们似乎经常碰壁。最新的问题是在包中包含模型。对于要调用的模型，我们使用根项目 config/composer 来访问这些模型，而不仅仅是服务提供者。感觉这个包正变得与项目配置紧密耦合。

有没有更好的方法来实现我们正在努力实现的目标？

编辑：

我忘记了 1 个 repo 上的多分支解决方案，但是在功能开发方面这不会变得丑陋吗？例子：

这在开发人员手中留下了相当多的破坏性合并权力？使用拉取请求读取访问权限可能是解决此问题的方法吗？