问题标签 [opencpu]

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opencpu - 向 OpenCPU Store 添加自定义函数

我想弄清楚如何向我的 OpenCPU 商店添加自定义功能。

我知道我们必须在 R/tmp 中创建一个对象。在 /home/ 中创建商店后,我们必须将该对象从 R/tmp 移动到 /home/store/ 使用:

PUT /home/[商店名称]/[对象名称]

使用 R/pub 中已经存在的函数/包很容易,但是当我尝试使用自己的自定义函数时,我卡住了。

我可以在此网页上使用我自己的自定义函数以第三种形式创建一个 R/tmp/[hashkey] 对象:

http://public.opencpu.org/userapps/opencpu/opencpu.demo/runco​​de/

返回:

所以我把它移到我的商店通过

PUT /home/[商店名称]/new.function

带参数:对象='x0188b9b9ce'

然后我看到:

但是当我:

我得到这个回应:

那么我做错了什么?

是的,我已经用实际的字符串替换了 [user name] 和 [store name],我只是想让它尽可能简单明了,并且与文档有明确的联系。

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opencpu - 调用opencpu自定义函数返回错误

我将一个函数 ( apistatus5) 上传到一个 opencpu 存储 ( ropensci_dash) 中:

https://public.opencpu.org/R/user/SChamberlain/ropensci_dash/apistatus5/ascii

我将函数放入我的用户名 () 下的 opencpu 中的存储中SChamberlain,但我不断收到错误消息:

STRING_ELT() 只能应用于“字符向量”,而不是“原始”

opencpu 是否有某种错误检测?该代码在我自己的 R 机器上运行良好,因此我不确定尝试运行时错误在哪里:

https://public.opencpu.org/R/user/SChamberlain/ropensci_dash/apistatus5/png

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r - 数据对象是否持久存在于 openCPU 的 R 会话中?

我想提供一个需要访问大型数据集的网络工具。优选地,这个 R 数据对象应该被加载到内存中一次,然后可用于用户定义的查询。

openCPU 框架是否以任何方式支持持久数据对象,还是每个查询都从空白开始?

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r - OpenCPU 如何在 R/pub 中安装一个包?

我不清楚如何在我自己的 openCPU 服务器上的 openCPU 中的 R/pub 下安装 R 包。openCPU 文档声明软件包安装由管理员处理,但没有给出任何关于软件包安装的说明(我可以找到)。

我确定我遗漏了一些明显的东西,但是对此的任何帮助将不胜感激。

FWIW,我正在尝试安装“markdown”包,由于某种原因在调用opencpu-cran.


更新: 我发现这个链接到一个例子。它调用以下 URL ,但基于此 SO 问题"/Radmin/call/opencpu.demo/install.opencpu/json",该方法似乎不起作用。那么,如果这不是通过 openCPU 安装软件包的方式,它是如何完成的呢?

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opencpu - 使用存储在 OpenCPU 服务器上的输出文件作为后续函数调用的输入

问题:如何使用存储在 OpenCPU 服务器上的输出文件作为另一个函数的输入?

背景: 我正在尝试在 openCPU 中使用knitrmarkdown生成 html,我可以使用它来更新带有页面加载统计信息的网页。

基本工作流程如下:

  1. 生成 .Rmd 文件,存储在本地。
  2. 访问使用 AJAX 将 .Rmd 文件上传到服务器上的 OpenCPU 实例的网页。
  3. knit通过 openCPU使用该函数将函数转换为存储在服务器上的 *.md 文件。
  4. 对存储在服务器上的文件使用该markdownToHTML函数(通过传入通过调用生成的适当哈希knit)并接收包含生成的 HTML 的 AJAX 回复。
  5. 使用新的 HTML 更新网页。

就目前而言,我的这个过程一直到第 4 步。我可以knit通过表单请求 POST 调用传入 .Rmd 文件,并且我收到来自 OpenCPU 的以下回复:

通过函数"test.md"生成的输出文件在哪里。knit现在,我尝试使用散列(在这种情况下"x7821c69f79",通过 POST 到/R/pub/markdown/markdownToHTML/ascii以下参数:

这将返回HTTP 400带有以下消息的错误:

但是,当我向 发出 GET 请求时,会返回/R/tmp/x7821c69f79/bin的内容。test.md所以我知道文件在调用knit.

那么,这里发生了什么?换句话说,如何使用存储在 OpenCPU 服务器上的输出文件作为另一个函数的输入?

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r - opencpu服务器,如何实现OAuth2接口?

我已经安装了 OpenCPU 服务器并试图让用户创建自己的登录名,但我不断收到以下错误消息:

关于我做错了什么的任何想法?

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r - Opencpu App-开发流程及部署

我发现了一个 R 包opencpu-demo,它作为应用程序安装在服务器上。但是,尚不清楚用户需要在/install目录中显式创建哪些文件以及如何将其与 R 函数联系起来。它是否需要嵌入 R 的 JavaScript,反之亦然。任何帮助或指向教程的指针将不胜感激。

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rapache - 在云中托管 R 时的内存要求

如果我们预计每月有 100,000 次点击,我们需要运行 opencpu 的最小服务器大小是多少?

我认为 opencpu 是一个令人兴奋的项目,但需要了解部署 opencpu 时的内存使用情况,因为诸如 rackspace 之类的云托管服务对于 1 GB 的 RAM 每月收费约 40 美元。

我知道如果我加载 R 而不做任何事情或在 RAM 中加载任何数据或包,它会使用近 700m 的 RAM(虚拟)和 50 兆字节的 RAM(驻留)。

我知道 opencpu 使用 rApache,而 rApache 使用 preforking,但想知道随着并发用户数量的增加,这将如何扩展。谢谢。

感谢您的回复

我在访问洛杉矶时与 Jeroen Ooms 进行了交谈,并且部分相信如果正确使用 opencpu 将在高并发环境中工作,并且如果出现问题,他可以解决问题。毕竟opencpu跟他的论文有关!特别是,我发现 opencpu 的有用之处在于它与 ubuntu 的 AppArmor 的集成,它可以限制进程使用过多的 RAM 和 CPU。我认为 apache 可能也可以做到这一点,但 RAppArmor 可以做到这一点以及更多。杰出的!如果 AppArmor 是唯一的优势,我只会使用它和 json 作为后端,但似乎 opencpu 也可以简化所有这些东西的安装并提供内置的 API 系统。

考虑到网络托管的成本,我想一个可行的实时分析系统如下:

  • 根据需要在专门的分析服务器上按需创建 R 统计模型(例如,每天或每小时使用 cron)
  • 使用 ftp 将模型的结果传输到 opencpu 服务器上的目录,作为本机 R 对象
  • 在 opencpu 服务器上,进入目录并获取代表统计模型的 R 对象,然后使用它进行预测或模拟。例如,使用“预测”函数根据用户提供的变量提供估计值。

有其他人认为这是使 R 成为实时分析后端的可行方法吗?

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r - R 包无法通过“opencpu knitr app”访问

几周前我开始玩 OpenCPU 并迷上了它。我能够成功安装“knitr”和“opencpu.demo”应用程序。我遇到的问题是当我尝试调用我打包在一个新的 r 包下的 R 函数并从 knitr-app 中调用它时。我收到一条消息说不存在这样的包。我从 R shell 和 knitr-app 界面运行了 installed.packages(lib.loc="/usr/lib/R/library") ,确实我的包出现在前者中,但没有出现在后一种情况下。不知道这里发生了什么!如果有人能回答这个问题,将不胜感激。

评论:当我通过 /R/pub/base/identity/json API 运行 find.package("DummyPkg") 时,我确实回来了

然而,来自 knitr-app 网页的相同查询返回:

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apache - preload[ ] 的 server.conf json 条目

我想在opencpu中预加载一些包。我尝试了文件 /etc/opencpu/server.conf 中 preload[ ] 的一些变体,但它不起作用。想知道进入“preload []”数组字段的正确语法是什么?任何例子都会有所帮助。