问题标签 [matplotlib-venn]

我正在使用 python 包 matplotlib_venn 来绘制维恩图。我想设置圆圈的大小，以便在不同的图中圆圈大小相同。我怎么能做到？

我想使用 Python 3 制作维恩图来显示分类数据。如果我这样做，说

然后我得到一个图表，其中包含与每个段相对应的条目数量，但我想要的是每个段中的实际条目（即，薯条，Rosy bit 中的蛋糕糖果，交叉路口中的巧克力以及 Steven 中的薯片和金块）。有没有办法使用 matplotlib_venn 做到这一点？

我想使用matplotlib_venn库Python3来绘制具有透明填充和仅边缘颜色的维恩图，几乎就像附件中一样，但我只有 2 个圆圈。
我找不到任何直接控制颜色的方法。请问有什么想法吗？

目前我有代码：

但这会导致填充和边缘一起着色。

我即将放弃 Anaconda。我从来没有遇到过管理包裹的问题pip，我只是想尝试一下，因为现在有一个包裹我无法使用，pip而且我听说过很多关于它的好消息。

我无法导入刚刚使用 Anaconda 安装的包，类似于此，但在 MacOS 而不是 Windows 上。

我真的不想要多个环境，除非我必须拥有它们。我希望能够从相同的脚本运行我的大部分/所有包。我有一个名为 py37 的虚拟环境，我一直在其中放置大部分东西。在其他软件包中：

Python 进行正确的安装：

我可以导入 numpy 但不能导入 matplotlib-venn：

...一堆东西然后：

类似地：

...一堆东西然后：

从 IDE spyder ( (py37) jennifers-mbp:~ jenniferlongdiaz$ spyder) 中，我得到：

请帮忙！

我正在使用matplotlib_venn.venn2函数在一个图中绘制四个不同的维恩图。

我对函数子集参数的输入是字符串集：

对于 v_ucla、v_ucsb 和 v_ucsd 也是如此。

当前结果：

但是，为了使比较更直观，我想在维恩图中显示百分比 而不是设置大小。是否可以通过 venn2 中的某些功能来做到这一点？

例如，第一个情节将被替换为：

我现在能想到的唯一选择是以某种方式自己进行标准化，然后将子集大小输入 venn2 函数，而不是集合，但我希望有一种更聪明的方法来做到这一点

是否可以使用 matplotlib-venn 显示通用集？我对 python 和 matplotlib 包都是新手，所以我实际上不确定什么是可能的，什么不是。

我正在尝试创建一个维恩图生成器，它接受每个圆的值，然后是一个参数（例如 A 交点 B），然后仅突出显示两个圆的交点。基本上，这就是我想要的输出。

我编写了以下代码来创建一个维恩图来显示 3 个集合的交集。我绘制的只是共同元素的数量。我想要的是在交叉点内打印真正的 A、B、C、... 不计算它们。有办法吗？

我的代码和输出：

我想要的是这样的：

我想绘制一个非常接近 R Limma 包所做的维恩图。

在这种情况下，我有一个不与其他两个重叠的集合。R包显示为“0”，但matplolib-venn画了另一个圆圈。

编辑：

我的3套是：

• 9
• 7 8 9 10
• 1 2 3 4 5 6

我的代码是：

谢谢你。

R Limma：https ://i.ibb.co/h9yhgm1/2019-05-07-Screen-Hunter-06.jpg

matplotlib_venn：https ://i.ibb.co/zx6YJbz/2019-05-07-Screen-Hunter-07.jpg

弗雷德

我想用 pybedtools 创建 VennDiagramms。有一个使用 matplotlib 的特殊脚本，称为 venn_mpl。当我在我的 jupyter notebook 中试用它时，它可以完美运行。您可以使用 python 或使用 shell 命令来完成。

不幸的是，当我想在我的蛇文件中使用它时出现了问题，我无法真正弄清楚问题是什么。

首先，这是脚本：venn_mpl.py

然后我的代码：

错误是：

snakemake-log 只给了我：

我已经尝试按照文档中的说明添加：

但这没有改变。

然后我的下一个想法是在使用我之前也测试过并且运行良好的 shell 命令时这样做。但是后来我得到了一个不同的但我认为非常相似的错误消息，我也没有找到合适的解决方案：

有谁知道这可能是什么原因以及如何解决它？

仅供参考：我说我测试了它，没有用snakemake运行它。这是我的工作代码：

在我的 shell 的 jupyter notebook 中：

我使用完整路径而不是变量的原因是，由于某种原因，代码无法使用 "$A" 调用变量。

我在 2 个数据帧中有很多字符串值，我想表示 venn2 交集中的常见值。

但是交叉点的大小变得非常小，并且文本超出了图形大小。像这样：

如果交叉点大小足够大，那就更好了。任何帮助都会很有用。谢谢。