问题标签 [drmaa]

您好我已经使用以下命令在 4 节点集群上安装了 gridengine：

它返回了：

因此，我已经完成了配置 gridengine 的所有必要步骤，并且它可以工作。

但是我想使用 python drmaa 库运行我的工作，并且我已经安装在主节点上：

因此，如果我使用以下脚本查询系统：

它返回：

但是，如果我尝试使用链接建议的脚本运行作业： http ://code.google.com/p/drmaa-python/wiki/Tutorial#Running_a_Job

它返回

有人可以帮我吗？怎么了。drmaa 库看起来能够与 gridengine 通信，但它无法运行作业。为什么会引发此错误？我真的很感激任何帮助。

嗨，我是 Drmaa 的新手，正在努力为一个项目工作。我已经在我的 Eclipse 中从这个位置http://www.java2s.com/Code/Jar/d/Downloaddrmaajar.htm安装了 drmaa.jar并尝试了一个简单的项目：Try.java：

当我运行这个程序时，我得到以下错误：

任何人都可以帮我解决它，因为我是新手，我已经用谷歌搜索了它，但无法获得足够的信息。谢谢 。我只是想解决这个问题，所以请大家帮忙。

我已经安装了 pbs-drmaa 库，但是在运行 C 程序时出现错误。

这是编译，我使用 -L 和 -I 来指示 pbs-drmaa 文件的正确文件夹。如图所示，没有编译错误：

但是当我尝试运行时，我得到一个错误：

但该文件存在于为 -L 指定的路径中：

我究竟做错了什么？

提前致谢。

我写了一个小 c 文件来测试 DRMAA，但它一直告诉我我使用的 DRMAA 函数没有定义。我在 C 代码中包含了 drmaa.h 文件。当我使用 -idrmaa 时出现此错误：

DRMAA 头文件位于此路径中：$SGE_ROOT/include/

如果我在没有 -ldrmaa 的情况下编译文件，我会收到此错误：

我正在使用我学校的 UNIX 系统，我对它很陌生。谁能帮我这个？

这是我的 drmtest.c 文件：

我想等待已在外部提交的作业完成。

我的第一个想法是通过调用qstat然后执行来获取 jobID session.wait(jobID, Session.TIMEOUT_WAIT_FOREVER);。但这不起作用。qstat除了在工作不再列出之前打电话之外还有其他想法吗？

我目前正在尝试编写代码来捕获异常，并且根据引发的异常，将导入与未引发异常时不同的模块。

第一个异常，ImportError即被捕获，捕获drmaa在执行过程中找不到python模块时抛出的异常import sge_execution_engine（里面sge_execution_engine有一条import drmaa语句）。第二个异常， ，在找到 python 库RuntimeError时被捕获（就像在执行中的语句期间一样），但C 库没有安装到操作系统中。我们希望这两个语句足以捕获当用户尝试在没有 python库、C 库或未安装 Sun Grid Engine 的机器上运行此模块时可能引发的所有可能的异常。没有任何这些收益，模块将继续drmaaimport drmaasge_execution_enginedrmaaexceptdrmaadrmaaimport local_execution_engine这样代码就可以在本地用户的机器上执行。现在，代码按预期工作，因为它在使用 sge 发现异常时会导入本地，但我们仍在寻求改进此处的异常处理以使其更加健壮。

在我看来，我认为将抛出的实际异常消息打印到标准输出是很好的，因为它可以让用户知道为什么他无法导入 sge_execution_engine 尤其是如果他不希望导入失败。

然而，我意识到，也许更好的方法是使用格式，然后打印出来，并调用与抛出和分配的异常相关的一些属性，而不是使用print sys.exc_info()实际在屏幕上打印异常消息到.except EXCEPTION as some_variable_nameprint some_variable_namesome_variable_name

我在Python 教程中看到这是在有这段代码的异常中完成的：

似乎该块通过专门调用对象的and属性以except IOError as e细粒度的方式处理异常消息。但是，当我查看文档时，我没有看到这些特定属性被列为异常文档的一部分。事实上，Python 文档中的所有其他异常也是如此，因此我们似乎无法确定哪些属性将与特定异常相关联。如果我们对此一无所知，那么当我们使用语法来处理我们的异常时，我们如何能够弄清楚要在对象上调用哪些属性呢？errnostrerrorIOErrorIOError some_variable_nameimport EXCEPTION as some_variable_name

我将不胜感激任何人对此的建议，即使您的回答没有直接回答我的问题，但是如果您对如何更好地处理我的异常有另一个完全不同的建议，请不要犹豫，发帖！

非常感谢！

当我尝试使用 python drmaa 包装器提交作业时，我收到 DeniedByDrmException：代码 17：作业被拒绝：肯定提交优先级需要操作员权限。

如何更改使用 Python DRMAA 包装器提交的作业的优先级？

我正在使用 lsf-drmaa 实现并通过 drmaa-python 进行接口。我通常将环境变量 $LSB_JOBINDEX 作为参数传递到我的 run.sh 脚本中。通过 drmaa-python，我创建JobTemplate jt并希望将其作为参数传递。我曾尝试使用 PARAMETRIC_INDEX，但此命令对我不起作用：jt.args = [str(drmaa.JobTemplate.PARAMETRIC_INDEX)].

我收到以下错误：

我在哪里出错和/或如何使用另一种方法传入索引？谢谢 -

我正在使用 Python drmaa 库在 SGE 集群上启动作业。我的服务在 REST API 上可用，在我的测试期间，一切正常，作业已提交/等待完成/完成后检索结果。进程在同一个 drmaa 会话中运行一次。

在我的 Web 界面上，作业未处理： - 作业提交 - 在 SGE 上启动的作业 - 另一时间的作业状态（通过调用 drmaa.session.jobStatus(jobId)

每次我运行进程以获取作业状态时，我都会收到“'jobid'指定的作业不存在。”

我想这是因为我没有在同一个 drmaa 会话中运行“提交”和“状态”请求。

有没有办法从另一个会话中获取工作状态？

谢谢。

使用 Grid Engine 之子的 DRMAA 接口我想获取运行特定作业的主机的名称。我想要以下内容（使用drmaa-python界面）

问题

1. 这可以通过 DRMAA 界面实现吗？看规格似乎不是，但我想我还是会问
2. 如果是这样，怎么做？