问题标签 [dismo]

我在 dismo 包中遇到了一些奇怪的错误，这让我很困惑。我在用着

但是，当我尝试通过以下方式简化模型时调用：

它运行，但出现以下错误：

这个错误对我来说没有多大意义，因为 gbm.step 的产品是一个标准列表，据我所知，它只包含双精度、列表、整数或符号类型（即没有原子向量）。

我一直在使用dismo，以前从未遇到过这个问题。但这是一个新的数据集。关于问题是什么的任何想法？数据集格式化？与其他包冲突？任何想法将不胜感激。

作为记录，我尝试将数据集保存为 csv，在旧版本的 R 上运行，删除 dismo 并重新安装包等。我目前能想到的似乎没有任何帮助。

谢谢

##入侵物种存在点栅格

我尝试将我的存在点与我的环境数据放在一起，这是我收到的错误消息

)

我想使用 lapply 将 dismo::maxent 应用于多个数据集的列表。但是我收到错误消息，即参数具有不同的行数，这很奇怪，因为我从另一个数据集创建了一个数据集，并且它们应该具有相同的行数（通过 nrow() 证明）。

该函数具有以下结构：

我试过了：

其中 dummy_presence_list 由

总结一下：我有两个列表：

1. split_data_env_df其中包含 2 个数据框，（一个有 3 行，第二个有 2 行，每行代表物种位置的环境变量）和每个 df（温度和降水）的 2 列

2. dummy_presence_list其中包含 2 个向量：c(1,1,1) 和 c(1,1) 告诉 maxent 公式来自 split_data 的环境参数意味着该物种存在于这些位置

我想使用 lapply 在每个列表的第一个元素和所述列表的第二个元素上运行 maxent(x, split_data_env_dfp dummy_presence_list)

通过 lapply 的 maxent 函数返回参数的行数不相等：3、2

我认为这与函数处理数据的方式有关，而不是与数据本身有关，因为行数实际上是相同的。请注意，这只是用于测试目的的简化数据集。我的实际数据集要大得多，所以让 lapply 工作会很好。谢谢 ：-）

我已经使用 R 中的 dismo 包运行了一个 maxent 模型。我可以使用 predict 函数将输出格式查看为“原始”或“cloglog”，但是当我尝试“累积”格式时，我得到“NA”值和空白输出。总之，此代码工作正常并生成彩色地图：

此代码不生成地图，仅生成 NA 值和空白图：

请帮忙，谢谢。

我想用存储在矩阵中的坐标对 SpatialPointsDataframe 进行子集化。到目前为止，我尝试过的内容如下：

但是，这不起作用。有什么建议么？

我已经阅读了使用不同机器学习方法（MaxEnt、随机森林、GBM ...）的 SDM 技术，并在使用包和其他方法的r环境下尝试了它们。dismo但是，据我所知，这些方法使用 0 和 1 的存在/不存在数据。

我正在使用一组数据，对于每个调查点，您都记录了目标物种的个体数量，无论是零个还是更多。我的问题是，是否有任何 SDM 方法可以考虑这些定量数据的存在？

我正在尝试通过 dismo 包运行 maxent 分发模型。但是，当我运行它时，Rstudio 中止并告诉我我需要旧版本的 java。当我尝试安装它时，操作系统（catalina）不允许我安装旧的 java，因为安装了较新的 java。是否有一种解决方法可以继续使用 dismo 进行建模？

提前致谢

我正在尝试通过 rJava 在 macOS 上的 dismo 包中运行 maxent 函数并不断收到此错误消息。

有没有人见过它并知道如何修复它？太感谢了！

我目前正在 dismo 包中的 R 中创建一个 maxent 模型。我使用 ENMevaluate 来评估我的模型的最佳设置。这导致以下代码：

现在我想使用预测功能。但是，我不确定我应该使用的论点。我是否必须使用与 maxent 模型中相同的参数，还是可以只使用以下代码？：

最好的问候，弗雷德里克

我目前正在开发一个 maxent 模型并且有两个问题。

1. 我有 12.000 个单元格，所以我认为由于过度拟合，10.000 个背景点会太多。但是，我不确定哪个数字足够（6.000？）。

2. 当我随机创建点时，一些网格单元格中的背景不止一个。这很好还是我必须过滤我的背景点，所以每个网格单元总是只有一个背景点？