问题标签 [datashader]

我有一个二维的 xarray DataArray。一个维度是频率，另一个是时间。创建 DataArray 时，我指定坐标。

我遇到的问题是，如果我将时间坐标 (dt) 定义为 pandas date_range 或 timedelta_range

或者

数据着色器抛出错误

跑完之后

但是，我可以将时间坐标指定为一个np.arange对象，它具有int类型并且工作正常。但是后来我从数组中丢失了日期时间信息。

有没有解决的办法？

我想绘制一个包含 3 列的时间序列数据框，每条曲线一个。我希望每条曲线都有自己的颜色并显示一个图例，hvplot()默认情况下也是如此。

这是一个独立的示例：

这是结果（左侧没有数据着色器，右侧有数据着色器）：

将绘图传递给数据着色器时，颜色和图例会丢失。使用 的datashade=True参数hvplot具有相同的结果。

Datashader 文档中有一个关于时间序列绘图的教程，但它非常复杂，它datashader.transfer_functions.shade()用作操作图形的基础，而没有过多介绍它的工作原理，而且 API 也不是很清晰。我只想保留 bokeh/hvplot 默认提供的这些基本绘图功能，我不确定 datashader 不保留它们的原因，所以我不知道要修复什么。

如何向数据着色器发出信号以保留不同的颜色并绘制图例？

我想使用数据着色器输出作为 plt 子图的输入。

我正在尝试运行此问题的答案中建议的代码： Add datashader image to matplotlib subplots

下面是代码：

我收到一个错误：

我尝试在此处查看 DSArtist 的源代码（https://github.com/holoviz/datashader/pull/200/files），但不太了解它。

如何解决错误？

谢谢！

在数据着色器中绘制一组数据时，如果 X 轴具有离散数字和欠采样，则会在可以看到背景的列之间留下间隙。

我一直试图通过尝试设置更大的点大小或使用 dynspread 传递函数来解决这个问题。不走运——很可能是我不知道应用这些的正确方法。

这是重现我的意思的示例代码：

当然，使用 bokeh 绘制相同的集合会显示相同的内容。更糟糕的是，如果你放大：

我对 Holoviews/DataShader/Bokeh 非常陌生，正在为研究项目分析这些库。我需要在散点图中绘制 10 亿个图，然后在图的套索上捕获选定的点，最好是选择的几何形状。

我确实遇到了这个例子——http: //holoviews.org/reference/streams/bokeh/Selection1D_points.html 我们需要通过DynamicMap 将您的选择流链接到holoviews 元素。然后，选择将保存您选择的索引。

下面是我尝试过并且成功获得几何图形的方法，但是绘图变得非常缓慢，如果它超过 100 万个点，我开始遇到浏览器内存问题，而且套索非常慢。

结果我也得到了两个图，因为单独的 hv.DynamicMap 不会显示这些点，我如何才能得到一个图。

我有一个 Geotiff，我在瓷砖地图上显示，但它稍微偏南。例如，在这个屏幕截图中，图像的边缘应该是国家边界所在的位置，但它有点偏南：

这是代码的相关部分：

你可以在 google colab 上看到 live notebook。

现在，当人们不将地图转换为 Web 墨卡托时，这不是常见的“一切都结束了”的问题。它几乎是完美的，但事实并非如此。

Geotiff 是一个地球引擎出口。这是它在 Earth Engine 中最初的样子（参见实时代码）：

正如您所见，图像随处可见。

起初，我怀疑可能是导出出错了，或者谷歌地图瓦片集有些不同，但不是，如果我在 Windows 笔记本电脑上的 QGis 应用程序中打开相同的导出 Tiff 并在同一个 OSM 瓦片地图上查看它在 colab 笔记本中，它看起来不错：

好的，图像没有完美地遵循边界，但我知道为什么而且这不相关（我过度简化了国家边界几何）。关键是，它被投影到正确的位置。因此，基于此，tiff 包含正确的信息，它可以显示在与 OSM tilemap 中的边界相同的位置，但在我的 Holoviews-Datashader-Bokeh 项目中，它仍然略有偏差。

知道为什么会这样吗？

我正在 Jupyter Notebook 中的 Python 中处理大数据（约 2500 万点），并希望拥有一个也不会永远加载的交互式图表。使用 Bokeh 为我提供了交互性，而 Holoviews 和 Datashader 允许相对快速地绘制数据。

Python：3.7.6
散景：1.4.0
Holoviews：
1.14.3 Numpy：1.19.5
Pandas：1.0.1
Numba：0.48.0

我运行这个示例代码没有问题：

这给出了一个很好的图表：

但是当我将 Holoviews 选项从“Points”切换到“Curve”（这是原始代码）时，如下所示：

我收到了这个很长的错误：

如果我删除“datashade”线并仅绘制 Holoviews 曲线图，那么它工作正常。但如果它是一个 2500 万点的图，那将需要很长时间，因此我需要 Datashader：

输出图：

关于可能导致此错误的任何想法？如果需要，我可以提供任何其他信息。

已安装的软件包

数据着色器 0.13.0，holoviews 1.14.4，geoviews 1.9.1.，散景 2.3.2。

我正在尝试做的事情

我正在尝试使用 Datashader 重新创建一个等值线图，其中一种颜色映射到大型 GeoDataFrame 中的一个类别，遵循管道页面中的这个示例以及这个以及这个SO，它们的语法和所有使用点都略有不同例如，而不是多边形。

可重现的代码示例

下面是完整数据集的一个小样本。

预期行为

我希望所有多边形都被光栅化并以每个类别的单一颜色显示。

观察到的行为

完整的数据集产生几乎是白色的图像，一些轮廓非常隐约可见。

如果我改变背景颜色，一些多边形会更加突出，尽管即使是标题也只是隐约可见。

这是否与 Datashader 计算有关，正如 Pipeline 笔记本所提到的，“根据每个类别对该像素的贡献，每个像素的透明度和颜色”？但是由于每个类别都是每个像素的唯一贡献者（即在这种情况下与其他类别没有空间重叠），为什么 alpha 似乎设置得如此之低以至于看不到任何东西？我还尝试了agg=ds.by('category')具有相同结果的聚合器。

顺便说一句，如果我删除“类别”列（否则会导致“输入必须是数字”错误）并将 GeoViews 与 HoloViews 结合使用，rasterize我可以毫无问题地使用一种颜色来可视化多边形，但我还没有弄清楚如何使用这种方法在同一个 Bokeh/或 mpl 图上绘制具有不同颜色映射的多个数据着色 GDF（通常的 HoloViews“叠加乘法”在这种情况下不起作用）。

我正在尝试通过以下方式导入 Python 的 datashader 包：

但我不断收到此错误：

发生异常：OSError 无法加载共享对象文件：llvmlite.dll

我尝试通过 conda 和 pip 安装/卸载软件包：

但我似乎无法修复。任何帮助表示赞赏。

我有非常大的数据集，我无法直接使用全息视图进行绘制。我想用分类数据制作散点图。不幸的是，我的数据非常稀疏，许多点都将 NA 作为类别。我想让这些点变灰。有什么方法可以让数据着色器知道我想做什么？

我向您展示我现在的做法（正如https://holoviews.org/user_guide/Large_Data.html中或多或少提出的那样）。我给你举个例子：

它产生以下图片：

您可以看到一些问题：最重要的是，虽然只有一个来自巴黎的人，但您会看到 NA 人（查理）也印有紫色，这是巴黎的颜色。有没有办法让点变灰？我尝试了很多情节，似乎 NA 总是采用图例中最后一项的颜色。

然后有一些我不想提出问题的小问题。（如果您认为他们应该提出自己的问题，请告诉我，我是 stackoverflow 的新手，感谢您的建议。）

另一个问题：这些点的大小并不相同。这是相当丑陋的。有没有办法改变它？

然后我还有一个问题：datashader内部是否也使用.cat.categories-method来决定使用什么颜色？数据着色器使用的颜色是如何确定的？因为我想知道图例是否总是按正确的顺序排列（显示正确的颜色：如果您在cats那时排列顺序color_key并且cats不再按相同的顺序并且图例显示错误的颜色）。它似乎总是像我一样工作，但我觉得有点不安全。

也许有人想给出他们的意见Points，在这种情况下是否可以用于散点图。因为我没有看到任何区别，Scatter并且在语义上也没有真正的一个变量会导致另一个变量（尽管有人可能会争辩说在这种情况下年龄会导致经验，但我将绘制不容易找到的变量那些类型的因果关系）所以Points如果我正确理解文档https://holoviews.org/reference/elements/bokeh/Points.html最好使用。