r - 加载包时禁用消息

Question

我在 R (ROCR) 中有一个包，需要在我的 R 环境中加载。加载包后，会打印一组消息。这通常很好，但由于我的 R 脚本的输出被用于进一步分析，我想完全禁用所有这些输出。我怎么做？此外，我更愿意在完全不必修改 ROCR 的情况下执行此操作，以便该脚本的未来用户也不必这样做。

至今：

• sink()在这里不起作用 - 将 stdout 和 std err 都重定向到/dev/null对我没有任何作用。
• 不出所料，options(warnings=-1)它也不做任何事情，因为这些本身并不是正在打印的警告。

有什么想法吗？

Answer 1

只需suppressMessages()在您的library()通话中使用：

edd@max:~$ R

R version 2.14.1 (2011-12-22)
Copyright (C) 2011 The R Foundation for Statistical Computing
ISBN 3-900051-07-0
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
[...]

R> suppressMessages(library(ROCR))
R>                                               # silently loaded
R> search() 
 [1] ".GlobalEnv"         "package:ROCR"         # it's really there      
 [3] "package:gplots"     "package:KernSmooth"
 [5] "package:grid"       "package:caTools"   
 [7] "package:bitops"     "package:gdata"     
 [9] "package:gtools"     "package:stats"     
[11] "package:graphics"   "package:grDevices" 
[13] "package:utils"      "package:datasets"  
[15] "package:methods"    "Autoloads"         
[17] "package:base"      
R> 

Answer 2

Dirk 的回答抑制了所有消息，并且不特定于加载包时生成的消息。

对所提问题的更准确的解决方案是：

suppressPackageStartupMessages(library(THE_PACKAGE_NAME))

可以在这里找到更详细的解释

Answer 3

使用suppressPackageStartupMessages，请参阅MehradMahmoudian的答案。为了完整起见，在此处添加使用示例：

对于一个库，使用suppressPackageStartupMessages(...)，例如：

suppressPackageStartupMessages(library(ggplot2))

对于多个库，请使用suppressPackageStartupMessages({...})，例如：

suppressPackageStartupMessages({
    library(ggplot2)
    library(ggdendro)
})

还请参见：
抑制包启动消息

Answer 4

通过添加quietly = T如下所示将解决问题：

suppressWarnings(suppressMessages(library("dplyr", quietly = T)))

如果有多个包，您可以使用：

## specify the package names
PKGs <- c("affy","gcrma","readxl","ggplot2","lattice" )

他们使用 lapply 如下：

lapply(PKGs, library, character.only = TRUE ,quietly = T)

Answer 5

library(ROCR, quietly = TRUE)可能是一个更优雅的选择。