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我有一些实验数据(对于 y、x、t_exp、m_exp),并希望使用受约束的多元 BFGS 方法找到该数据的“最佳”模型参数(A、B、C、D、E) 。参数 E 必须大于 0,其他不受约束。

def func(x, A, B, C, D, E, *args):
    return A * (x ** E) * numpy.cos(t_exp) * (1 - numpy.exp((-2 * B * x) / numpy.cos(t_exp))) +  numpy.exp((-2 * B * x) / numpy.cos(t_exp)) * C + (D * m_exp)

initial_values = numpy.array([-10, 2, -20, 0.3, 0.25])
mybounds = [(None,None), (None,None), (None,None), (None,None), (0, None)]
x,f,d = scipy.optimize.fmin_l_bfgs_b(func, x0=initial_values, args=(m_exp, t_exp), bounds=mybounds)

几个问题:

  1. 我的模型公式应该func包括我的自变量x还是应该从实验数据中提供x_exp作为 的一部分*args
  2. 当我运行上面的代码时,我得到一个错误func() takes at least 6 arguments (3 given),我假设是 x,我的两个 *args ......我应该如何定义func

编辑:感谢@zephyr 的回答,我现在明白目标是最小化残差平方和,而不是实际函数。我得到了以下工作代码:

def func(params, *args):
    l_exp = args[0]
    s_exp = args[1]
    m_exp = args[2]
    t_exp = args[3]
    A, B, C, D, E = params
    s_model = A * (l_exp ** E) * numpy.cos(t_exp) * (1 - numpy.exp((-2 * B * l_exp) / numpy.cos(t_exp))) +  numpy.exp((-2 * B * l_exp) / numpy.cos(theta_exp)) * C + (D * m_exp)
    residual = s_exp - s_model
    return numpy.sum(residual ** 2)

initial_values = numpy.array([-10, 2, -20, 0.3, 0.25])
mybounds = [(None,None), (None,None), (None,None), (None,None), (0,None)]

x, f, d = scipy.optimize.fmin_l_bfgs_b(func, x0=initial_values, args=(l_exp, s_exp, m_exp, t_exp), bounds=mybounds, approx_grad=True)

我不确定界限是否正常工作。当我为 E 指定 (0, None) 时,我得到一个运行标志 2,异常终止。如果我将其设置为 (1e-6, None),它运行良好,但选择 1e-6 作为 E。我是否正确指定了边界?

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我不想试图弄清楚你使用的模型代表什么,所以这里有一个适合一行的简单示例:

x_true = arange(0,10,0.1)
m_true = 2.5
b_true = 1.0
y_true = m_true*x_true + b_true

定义函数(参数,*args):
    x = 参数[0]
    y = 参数[1]
    m, b = 参数
    y_model = m*x+b
    错误 = y-y_model
    返回总和(错误**2)

初始值 = numpy.array([1.0, 0.0])
mybounds = [(None,2), (None,None)]

scipy.optimize.fmin_l_bfgs_b(func, x0=initial_values, args=(x_true,y_true), approx_grad=True)
scipy.optimize.fmin_l_bfgs_b(func, x0=initial_values, args=(x_true, y_true), bounds=mybounds, approx_grad=True)

第一个优化是无界的,并给出了正确的答案,第二个优化了阻止它达到正确参数的界限。

重要的是,对于几乎所有优化函数,“x”和“x0”指的是您正在优化的参数 - 其他所有内容都作为参数传递。您的 fit 函数返回正确的数据类型也很重要 - 这里我们需要一个值,一些例程需要一个错误向量。此外,您还需要 approx_grad=True 标志,除非您想分析计算梯度并提供它。

于 2011-12-29T19:55:05.713 回答