我正在从 [0,1] 范围内levelplot的因子中创建一个格子：xy
x y level
1 m3134 m3134 1.0000000
2 m3134 m416B 0.4189057
3 m416B m3134 0.2696508
4 m3134 mA20 0.3322170
5 mA20 m3134 0.2454191
6 m3134 mB 0.3176792
...
这是我用来根据这些数据制作图形的 R 脚本：
#!/foo/bar/bin/Rscript --vanilla
args <- commandArgs(TRUE)
mtxFn <- args[1]
pdfFn <- args[2]
mtx <- read.table(mtxFn, col.names=c("x", "y", "level"))
mtx$level[(mtx$level == 1)] <- NA
library(lattice)
trellis.device(dev=pdf, file=pdfFn)
colors <- colorRampPalette(c('red', 'white'))(256)
fig <- levelplot(level~x*y,
data=mtx,
col.regions=colors,
xlab="",
ylab="",
aspect="iso",
scales=list(
x=list(rot=90)
),
panel=function(...) {
arg <- list(...)
panel.levelplot(...)
panel.text(mtx$x, mtx$y, round(mtx$level*100,0), cex=0.5)
}
)
print(fig)
graphics.off();
这工作正常。我得到下图：
但是，NA我不想将单元格标记为 ，而是将它们保留为值，而是将 10（级别）和 79（级别）之间1.00的所有单元格着色为。任何大于 79 的东西都会被着色为与使用近似值应用于单元格的颜色相同的颜色。级别为 79。或者，最好将所述单元格着色为黑色，其中根本没有文本。0.100.79colors
有没有办法用levelplot和格子来完成这个？
最终编辑
这并没有给出太多的颜色渐变，但我已经足够接近我会奖励赏金，也许会考虑ggplot2作为替代方案。感谢您为此付出的所有辛勤工作。
这是我的脚本的最终编辑：
#! /foo/bar/bin/Rscript --vanilla
args <- commandArgs(TRUE)
dfFn <- args[1]
pdfFn <- args[2]
df <- read.table(dfFn,
col.names=c("x", "y", "level"),
stringsAsFactors=TRUE,
colClasses=c("factor", "factor", "numeric"))
df$level <- round(df$level*100, 0)
# reorder cell type row-factors (in reverse of given order)
df$y <- factor(df$y, levels=unique(df$y[length(df$y):1]))
lowestValue <- min(df$level)
secondHighestValue <- unique(sort(df$level, decreasing=TRUE))[2]
n <- 10
col.seq <- seq(lowestValue, secondHighestValue, length.out=n)
brks <- c(0, col.seq, Inf)
cuts <- cut(df$level, breaks = brks)
colors <- colorRampPalette(c("white", "red"))(length(levels(cuts))-1)
colors <- c(colors, "black")
cls <- rep(colors, times = table(cuts))
library(lattice)
trellis.device(dev=pdf, file=pdfFn)
fig <- levelplot(cuts~x*y,
data = df,
cuts = n,
col.regions=cls,
xlab="",
ylab="",
aspect="iso",
scales=list(
x=list(rot=90)
),
panel=function(...) {
arg <- list(...)
panel.levelplot(...)
panel.text(df$x, df$y, df$level, cex=0.5)
},
colorkey=list(col=colorRampPalette(c("white", "red"))(length(col.seq)), at=col.seq)
)
print(fig)
graphics.off()
这是levelplot这个脚本所做的：
如果我n在上面增加15，单元格着色再次中断，返回到亮红色的对角线，而不是黑色（如图所示）。
