r - 我可以在 ggplot2 中获得箱线图缺口吗？

Question

是的，我知道它已经存在了，我还在谷歌群组上找到了哈德利的回答，即箱线图还没有缺口ggplot2。所以我的问题是双重的：这是否改变了（已经有一个原生的缺口实现），如果没有，有什么可以做的。

我的意思是我不需要缺口光学元件，它通过一些阴影区域来表示置信范围，该阴影区域适当地放置在箱线图上的另一层中，看起来也不错。

还添加了一个截图，因为我听说一个图形问题没有图形就永远不完整

Answer 1

更新 除了下面详述的选项外，ggplot2的 0.9.0 版在geom_boxplot. 检查?geom_boxplot揭示了一个notch和notchwidth论点：

+ geom_boxplot(notch = TRUE, notchwidth = 0.5)

---

不是优雅的图形，但这里有一个例子：

# confidence interval calculated by `boxplot.stats`
f <- function(x) {
    ans <- boxplot.stats(x)
    data.frame(ymin = ans$conf[1], ymax = ans$conf[2])
}

# overlay plot (upper panel below)
p <- ggplot(iris, aes(Species, Sepal.Length)) + geom_boxplot() +
  stat_summary(fun.data = f, geom = "linerange", colour = "skyblue", size = 5)
p

# base graphics (lower panel below)
boxplot(Sepal.Length ~ Species, data = iris, notch = TRUE)

您可以通过调整stat_summary.

横杆版本：

f <- function(x) {
  ans <- boxplot.stats(x)
  data.frame(ymin = ans$conf[1], ymax = ans$conf[2], y = ans$stats[3])
}

p <- ggplot(iris, aes(Species, Sepal.Length)) + 
  geom_boxplot(width = 0.8) +
  stat_summary(fun.data = f, geom = "crossbar", 
    colour = NA, fill = "skyblue", width = 0.8, alpha = 0.5)
p

Answer 2

有趣的是，在ggplot2-dev 邮件列表上发布了一篇关于缺口箱形图的帖子。

你可以在github上找到开发页面。该软件包可以通过以下方式安装：

# install.packages("devtools")
library(devtools)
install_github("ggplot2")