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我知道 BLAST(基本局部对齐搜索工具)的设计目的。但我对使用这种高级文本比较及其最终效果很感兴趣。

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您可以使用 vmatch。

如果您想使用工具进行子字符串的局部对齐,您可能想要使用 STELLAR,论文: http: //www.biomedcentral.com/1471-2105/12/S9/S15/

它完成了 blast 所做的一切,但有非常方便的选项来使用字符。

于 2012-08-22T07:51:44.810 回答