我已经对大量基因进行了差异表达，并且我只选择了我想要研究的外部基因列表中的重要基因。当我在条形图上表示我的重要值时，我从带有 limma 的缓和 t 检验（BH 校正）获得的 p 值不一样；对于条形图，我使用了 ggpubr 的函数 stat_compare_means() 并且出现的 p 值与使用 limma 获得的 p 值完全不同且异常。
有谁知道这是否正常？
我绘制的基因应该是正确的，我检查了多次。
谢谢
我已经对大量基因进行了差异表达，并且我只选择了我想要研究的外部基因列表中的重要基因。当我在条形图上表示我的重要值时，我从带有 limma 的缓和 t 检验（BH 校正）获得的 p 值不一样；对于条形图，我使用了 ggpubr 的函数 stat_compare_means() 并且出现的 p 值与使用 limma 获得的 p 值完全不同且异常。
有谁知道这是否正常？
我绘制的基因应该是正确的，我检查了多次。
谢谢