使用 计算相对丰度phyloseq。
我想为每个样本创建一个图而不使用merge_samples.
这是我的代码：
carbom1 <- subset_taxa(carbom, Phylum %in% c(" p__Firmicutes", " p__Bacteroidota", " p__Proteobacteria",
" p__Fusobacteriota", " p__Actinobacteriota"))
ps <- tax_glom(carbom1, "Phylum")
ps0 <- transform_sample_counts(ps, function(x) x / sum(x))
ps0
phyloseq-class 实验级对象
otu_table() OTU 表：[5 个分类单元和 18 个样本]
sample_data() 样本数据：[ 2 个样本变量的 18 个样本]
tax_table() 分类表：[ 7 个分类等级的 5 个分类群]
如何绘制每个样本的图ps0？