首先我想提一下，我不是程序员，也没有英语母语，但我会尽力做到最好:-)
我一直在寻找一种方法来创建一些漂亮的圆形可视化（和弦图）并在 Circos（http://circos.ca）上遇到困难，这似乎符合我的需求。
安装一直很顺利，直到最后一步，我遇到了 GD 的问题，并在尝试修复它时绕着圈子跑。
这里有一些细节：
- MacBook Air（视网膜显示屏，13 英寸，2020 年）
- macOS 蒙特雷版本 12.0.1 (21A559)
- 马戏团 0.69-9
- Perl v5.34.0
我已经成功安装了一堆 perl 不同的模块:-)
如果使用 perl 模块进行检查circos -modules，则缺少两个，这就是问题开始的地方：
ok 1.52 Carp
ok 0.45 Clone
ok 2.63 Config::General
ok 3.80 Cwd
ok 2.179 Data::Dumper
ok 2.58 Digest::MD5
ok 2.85 File::Basename
ok 3.80 File::Spec::Functions
ok 0.2311 File::Temp
ok 1.52 FindBin
ok 0.39 Font::TTF::Font
missing GD
missing GD::Polyline
ok 2.52 Getopt::Long
ok 1.46 IO::File
ok 0.430 List::MoreUtils
ok 1.55 List::Util
ok 0.01 Math::Bezier
ok 1.999818 Math::BigFloat
ok 0.07 Math::Round
ok 0.08 Math::VecStat
ok 1.03_01 Memoize
ok 1.97 POSIX
ok 1.30 Params::Validate
ok 2.01 Pod::Usage
ok 2.05 Readonly
ok 2017060201 Regexp::Common
ok 2.84 SVG
ok 1.19 Set::IntSpan
ok 1.6611 Statistics::Basic
ok 3.23 Storable
ok 1.23 Sys::Hostname
ok 2.04 Text::Balanced
ok 0.61 Text::Format
ok 1.9767 Time::HiRes
我尝试了各种方法并广泛搜索，但我无法让这两个 GD perl 模块正常工作。
当我使用 brew 安装 GD 时，它似乎安装得很好，但是在检查使用时circos -modules我得到：
dyld [14230]：缺少符号调用
卸载 usingbrew uninstall --ignore-dependencies gd并再次检查后，再次circos -modules报告两个丢失的模块，并且不再显示 dyld 错误。
所以我尝试了一些我不太清楚自己在做什么的事情:-)
...并下载GD 2.73并编译...
perl Makefile.PL --ignore_missing_gd
Where is libgd installed? [/usr/lib] /usr/local/Cellar/
Please choose the features that match how libgd was built:
Build JPEG support? [y] y
Build PNG support? [y] y
Build FreeType support? [y] y
Build GIF support? [y] n
Build XPM support? [y] n
If you experience compile problems, please check the @INC, @LIBPATH and @LIBS
arrays defined in Makefile.PL and manually adjust, if necessary.
Checking if your kit is complete...
Looks good
Generating a Unix-style Makefile
Writing Makefile for GD
Writing MYMETA.yml and MYMETA.json
所以我被鼓励运行该make命令，但不幸的是已经报告了大量警告，所以我决定不继续sudo make install
现在，当我再次检查时，circos -modules我再次遇到同样的错误:-(
重复brew uninstall --ignore-dependencies gd相同的模块丢失后再次报告，我又回到了循环的开头。
在这里，我被困住并在圈子里跑来跑去，任何提示或很少的帮助将不胜感激。
感谢，并有一个愉快的一天！
同时，我关注了@Håkon Hægland 发布的链接
在 Mac OS Big Sur 版本 11.0.1 上安装 circos 时缺少 GD
所以我做了以下事情：
brew install pkg-config
Running `brew update --preinstall`...
==> Auto-updated Homebrew!
Updated Homebrew from cf4848b17 to e76dce1ae.
Updated 1 tap (homebrew/core).
==> Updated Formulae
Updated 16 formulae.
Warning: pkg-config 0.29.2_3 is already installed and up-to-date.
To reinstall 0.29.2_3, run:
brew reinstall pkg-config
brew install libgd
==> Downloading https://ghcr.io/v2/homebrew/core/gd/manifests/2.3.3_1
Already downloaded: /Users/dirk/Library/Caches/Homebrew/downloads/fb430dd3c55c9f1f523cb280513372f2cc630661b0adf7c78e40dbbb040fe81c--gd-2.3.3_1.bottle_manifest.json
==> Downloading https://ghcr.io/v2/homebrew/core/gd/blobs/sha256:8976ef6710a704e27557e1ad9c2b3aecf9b0b3dc266b212922a6ac22
Already downloaded: /Users/dirk/Library/Caches/Homebrew/downloads/641ee2beaa19a84d66e7e62cb57a1b792eb02fb05306fbfe9ee15b4741649622--gd--2.3.3_1.monterey.bottle.tar.gz
==> Pouring gd--2.3.3_1.monterey.bottle.tar.gz
/usr/local/Cellar/gd/2.3.3_1: 33 files, 1.4MB
==> Running `brew cleanup gd`...
Disable this behaviour by setting HOMEBREW_NO_INSTALL_CLEANUP.
Hide these hints with HOMEBREW_NO_ENV_HINTS (see `man brew`).
cpanm GD
GD is up to date. (2.73)
但是当重新运行时circos -modules，我再次收到以下错误：
dyld[3534]: missing symbol called
zsh: abort circos -modules
还在兜圈子，只是绝望，现在该睡觉了，明天又是新的一天……
感谢所有人的帮助和晚安:-)