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我想可视化具有多个基因组的 ba​​m 文件。我使用 samtools 对其进行了排序,并得到了一个索引文件。

我首先尝试了 Qualimap,但是当生成跨参考的覆盖范围时,结果并不好,因为值在轴末端重叠。随附的

我需要获得更好的可视化。我使用了各种工具,IGV、GenomeWorkbench 甚至 ngscat,但其中很多工具不接受我的 bam 文件,因为它有几种/多种类型的基因组(病毒和人类)。我需要一个可以接受它并给我一个更清晰的图表的工具

谢谢!

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