r - 为什么最适合我的 scRNA-seq 数据集的 UMAP PC 只有三台？

Question

起初我们知道UMAP生殖细胞的图 ( scRNA-seq) 总是出现连续的，像这样：

我有一个鱼睾丸（几乎是95%生殖细胞）的单细胞转录组数据集，我应该将 PC 设置为UMAP仅以3确保绘图正常连续。当PCs达到4或更高时，拓扑结构将被扭曲和破裂，因此根本无法提供生殖细胞发育的伪时间知识。

这是情节，当PCs=3：

第一个图表示3组成数据集的样本（m10、m30、m60）。

这是情节何时 PCs=4和10：：

谢谢您的帮助！