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我想自动计数细胞,我通常用 ImageJ 来做

我可以使用子进程打开 imagej

subprocess.Popen(r"path\ImageJ\ImageJ.exe")

我想从 python 将图像上传到 imagej

然后使用以下代码从 python 运行 imagej 宏(编辑图像文件并设置阈值):

subprocess.Popen(r"path\ij153-win-java8\ImageJ\macros\autocount.ijm")

如何通过 python 在 ImageJ 中打开图像?完整代码:

#import libraries
import subprocess

#open imageJ
subprocess.Popen(r"path\ij153-win-java8\ImageJ\ImageJ.exe")

#open file in imageJ


#open imageJ macro
subprocess.Popen(r"path\ij153-win-java8\ImageJ\macros\autocount.ijm")
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