我想自动计数细胞,我通常用 ImageJ 来做
我可以使用子进程打开 imagej
subprocess.Popen(r"path\ImageJ\ImageJ.exe")
我想从 python 将图像上传到 imagej
然后使用以下代码从 python 运行 imagej 宏(编辑图像文件并设置阈值):
subprocess.Popen(r"path\ij153-win-java8\ImageJ\macros\autocount.ijm")
如何通过 python 在 ImageJ 中打开图像?完整代码:
#import libraries
import subprocess
#open imageJ
subprocess.Popen(r"path\ij153-win-java8\ImageJ\ImageJ.exe")
#open file in imageJ
#open imageJ macro
subprocess.Popen(r"path\ij153-win-java8\ImageJ\macros\autocount.ijm")