我正在学习 Seurat 进行聚类并找到每个聚类的标记。我找到了使用该功能的集群
FindClusters(scRNA_data, resolution = 5.1)
并获得 20 个簇(Idents(scRNA-seq) 显示级别 0,1,...,19)。我想为每个集群找到标记基因。但是,当我尝试
FindMarkers(scRNA_data, ident.1 = 10)
有错误信息
Error in WhichCells.Seurat(object = object, idents = ident.1) : Cannot find the following identities in the object: 10
其余的 11、12、...、19 都发生了这种情况。但是,例如,这很好,
FindMarkers(scRNA_data, ident.1 = 1)
可以请任何人帮忙解决发生的事情吗?