我有一个正态分布图和一个直方图，其中 x 轴以对数刻度显示 0、10^0、10^1 ...我想在主要刻度之间包含次要刻度。实际上，我能够使用上一个问题中给我的解决方案将主要刻度格式从 1、2、3 等更改为 10^0、10^1、10^2、10^3 。我对主要刻度使用了以下代码：
major.ticks <- axTicks(1)
labels <- sapply(major.ticks,function(i)
as.expression(bquote(10^ .(i)))
)
axis(1,at=major.ticks,labels=labels)
可以将其编辑为仅标记次要刻度而不标记它们吗？
minor.tick包中有一个函数Hmisc，但该函数不能很好地处理对数刻度。我使用以下函数来获取遵循对数刻度的小刻度。ax是您使用它的轴（与 function 相同axis），n是次要刻度的数量（默认为 9），t.ratio是主要和次要刻度之间的比率，...您可以将额外参数传递给axis
编辑：评论中的好主意，所以我编辑了我的功能。有两个额外的参数，mn对数刻度上mx的最小值和最大值（因此意味着最小值是 10^0 或 1 ！）mn=0
功能：
minor.ticks.axis <- function(ax,n,t.ratio=0.5,mn,mx,...){
lims <- par("usr")
if(ax %in%c(1,3)) lims <- lims[1:2] else lims[3:4]
major.ticks <- pretty(lims,n=5)
if(missing(mn)) mn <- min(major.ticks)
if(missing(mx)) mx <- max(major.ticks)
major.ticks <- major.ticks[major.ticks >= mn & major.ticks <= mx]
labels <- sapply(major.ticks,function(i)
as.expression(bquote(10^ .(i)))
)
axis(ax,at=major.ticks,labels=labels,...)
n <- n+2
minors <- log10(pretty(10^major.ticks[1:2],n))-major.ticks[1]
minors <- minors[-c(1,n)]
minor.ticks = c(outer(minors,major.ticks,`+`))
minor.ticks <- minor.ticks[minor.ticks > mn & minor.ticks < mx]
axis(ax,at=minor.ticks,tcl=par("tcl")*t.ratio,labels=FALSE)
}
这可以应用如下：
x <- 10^(0:8)
y <- 1:9
plot(log10(x),y,xaxt="n",xlab="x",xlim=c(0,9))
minor.ticks.axis(1,9,mn=0,mx=8)
给出：
这是一个简单的函数：
log10.axis <- function(side, at, ...) {
at.minor <- log10(outer(1:9, 10^(min(at):max(at))))
lab <- sapply(at, function(i) as.expression(bquote(10^ .(i))))
axis(side=side, at=at.minor, labels=NA, tcl=par("tcl")*0.5, ...)
axis(side=side, at=at, labels=lab, ...)
}
这是一个例子：
x <- exp(rnorm(200, 5))
hist(log(x), 20, xaxt="n", xlim=c(0, 8))
log10.axis(1, at=seq(0, 8, 2))
给出：
尝试使用magicaxismagaxis包。
在ggplot2中，我们可以与和annotation_logticks一起使用。以下是从上面的链接中获取的示例。scales::trans_breaksscales::trans_format
library(ggplot2)
a <- ggplot(msleep, aes(bodywt, brainwt)) +
geom_point(na.rm = TRUE) +
scale_x_log10(
breaks = scales::trans_breaks("log10", function(x) 10^x),
labels = scales::trans_format("log10", scales::math_format(10^.x))
) +
scale_y_log10(
breaks = scales::trans_breaks("log10", function(x) 10^x),
labels = scales::trans_format("log10", scales::math_format(10^.x))
) +
theme_bw()
a + annotation_logticks() # Default: log ticks on bottom and left
包中有一个minorAxis函数StratigrapheR，可以用于任何类型的小刻度。它可以与生成seq_log对数刻度的函数一起使用：
library(StratigrapheR)
x <- exp(rnorm(200, 5))
hist(log10(x), 20, xaxt="n", xlim=c(0, 4), xlab = "x", main = "Logarithmic Histogram of x")
ticks <- seq_log(10^0,10^4, divide = T)
lab <- sapply(0:4, function(i) as.expression(bquote(10^ .(i))))
minorAxis(1, at.maj = log10(ticks[[1]]), at.min = log10(ticks[[2]]), labels = lab)
给出：
用于""次要刻度的标签。
有一个小错误，
lims<-lims[3:4]失踪
minor.ticks.axis <- function(ax,n,t.ratio=0.5,mn,mx,...){
lims <- par("usr")
if(ax %in%c(1,3)) lims <- lims[1:2] else lims <- lims[3:4]
major.ticks <- pretty(lims,n=5)
if(missing(mn)) mn <- min(major.ticks)
if(missing(mx)) mx <- max(major.ticks)
major.ticks <- major.ticks[major.ticks >= mn & major.ticks <= mx]
labels <- sapply(major.ticks,function(i)
as.expression(bquote(10^ .(i)))
)
axis(ax,at=major.ticks,labels=labels,...)
n <- n+2
minors <- log10(pretty(10^major.ticks[1:2],n))-major.ticks[1]
minors <- minors[-c(1,n)]
minor.ticks = c(outer(minors,major.ticks,`+`))
minor.ticks <- minor.ticks[minor.ticks > mn & minor.ticks < mx]
axis(ax,at=minor.ticks,tcl=par("tcl")*t.ratio,labels=FALSE)
}
此页面上第一个图中的 x 轴标签有误。次要刻度未正确分布。