1

在使用了 -excl 设置的 bedtools 后，我注意到排除文件具有数字命名约定，而我的输入文件具有“chr”命名约定。有人知道这是否会导致任何问题？我已经生成了许多洗牌文件，没有任何错误或警告，一切似乎都很好，所以我想知道在我最终需要重做所有事情之前是否有人知道这一点？

4

1 回答 1

1

好的，所以我快速运行了一个小测试数据，确认 -excl 仅在我们有命名约定时才有效，但当我们有不一致的约定时它不会警告用户。这是非常令人担忧的国际海事组织。

（床具 v2.30.0）

于 2021-09-15T09:06:40.790 回答