我对 scRNA 数据的分析完全陌生，并且在 R 中遇到了 CreateSeuratObject 命令的问题。
本质上，我在一个名为 X 的 csv 文件中有基因表达矩阵，第一行是细胞，第一列是 ENSG 基因代码，矩阵中表示的计数数。
基因名称采用 ENSG 格式，因此我将此数据框与geneID 数据框合并，然后使用以下代码删除ENSG 列。
X <- merge(X, geneidname, by.x="V1", by.y="gene_id")
X<-X[,c(19144, 1:19143)]
X$V1 <- NULL
最终结果是一个矩阵，其中第一列是基因矩阵，第一行是细胞，计数数据在矩阵的相应位置。
但是，当我尝试使用创建 seurat 对象时
`X_seurat <- CreateSeuratObject(counts = X, project = "X_seurat", min.cells = 5)
最终结果是一个 Seurat 类对象 1 个测定中 X 个样本的 0 个特征 主动测定：RNA（0 个特征，0 个可变特征）
但是，当使用代码 X <-X[,-1] 删除第一列，然后尝试再次重复创建 SeuratObject 时，它可以工作，给我一个 Seurat XXX 类的对象，在 1 个测定中跨越 19142 个样本 主动测定：RNA（XXX特征，0可变特征）
我对此感到非常困惑。为什么我无法创建包含基因名称列的 seuratObject。我已经检查过，基因名称列类是“字符”，其余列类是“整数”。对我来说，应该删除基因名称以便能够创建 Seurat 对象似乎有点违反直觉，而且我显然在某个地方出错了——有人可以帮忙吗？提前致谢！！