我可以将一个 ann 文件读入 pandas 数据帧,如下所示:
df = pd.read_csv('something/something.ann', sep='^([^\s]*)\s', engine='python', header=None).drop(0, axis=1)
df.head()
但我不知道如何将多个 ann 文件读入一个 pandas 数据帧。我尝试使用concat
,但结果不是我所期望的。
如何将多个 ann 文件读入一个 pandas 数据帧?
听起来您需要使用从文件夹glob
中提取所有.ann
文件并将它们添加到数据框列表中。之后,您可能希望根据需要加入/合并/连接等。
我不知道您的确切要求,但下面的代码应该让您接近。就目前脚本所假设的那样,从您运行 Python 脚本的位置,您有一个名为的子文件夹files
,并且您想要拉入所有.ann
文件(它不会查看其他任何内容)。显然,根据需要进行审查和更改,因为它是每行注释的。
import pandas as pd
import glob
path = r'./files' # use your path
all_files = glob.glob(path + "/*.ann")
# create empty list to hold dataframes from files found
dfs = []
# for each file in the path above ending .ann
for file in all_files:
#open the file
df = pd.read_csv(file, sep='^([^\s]*)\s', engine='python', header=None).drop(0, axis=1)
#add this new (temp during the looping) frame to the end of the list
dfs.append(df)
#at this point you have a list of frames with each list item as one .ann file. Like [annFile1, annFile2, etc.] - just not those names.
#handle a list that is empty
if len(dfs) == 0:
print('No files found.')
#create a dummy frame
df = pd.DataFrame()
#or have only one item/frame and get it out
elif len(dfs) == 1:
df = dfs[0]
#or concatenate more than one frame together
else: #modify this join as required.
df = pd.concat(dfs, ignore_index=True)
df = df.reset_index(drop=True)
#check what you've got
print(df.head())