我可以访问具有很多节点的集群。我正在使用以下命令运行我的 Nextflow 工作流程:
./nextflow kuberun user/repo -c nextflow.config -profile kubernetes -v my_pvc:/mounted_path -with-report _report.html -with-trace _trace
我想在一组特定的节点上运行我的 nextflow 工作流。我已经标记了我感兴趣的节点:
kubectl label nodes node1 disktype=my_experiment
kubectl label nodes node2 disktype=my_experiment
kubectl label nodes node3 disktype=my_experiment
我从 Nextflow 和 Kubernetes 文档中无法理解如何安排我的工作流程,而这些流程在我感兴趣的节点之间进行拆分。
我只了解如何使用 kubernete:https ://kubernetes.io/docs/concepts/overview/working-with-objects/labels/
但不是如何nextflow kuberun
命令。
非常感谢任何帮助,谢谢!