我正在尝试使用 Minimap2 将 Oxford Nanopore cDNA 读数映射到参考。我正在从终端在 unix 环境中使用 macbook。我已经下载了我的 fastq 文件和我的参考基因组,我已经按照GitHub 上的教程下载了 Minimap2 ,代码如下:
curl -L https://github.com/lh3/minimap2/releases/download/v2.21/minimap2-2.21_x64-linux.tar.bz2 | tar -jxvf -
然后尝试使用以下命令运行 Minimap2:
minimap2 -ax splice ref.fa nanopore-cdna.fa > aln.sam
但输出是:-bash: minimap2: command not found
所以看起来 minimap2 没有安装,但我可以看到包含名为 minimap2 的 Unix 可执行文件的文件夹。我该如何安装它?我的生物信息学经验很少,所以如果这是非常基本的,我深表歉意......
谢谢!