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我是 RNA-seq 分析的新手,我想对 log2(TPM+1) 数据进行 DE 分析。我知道这并不理想,但这是我可以从以前的数据集中获得的输入数据。我正在考虑使用 Limma 趋势和 eBayes,而不是使用我的 log2(TPM+1)使用 logCPM(推荐)。这是一个好主意吗?我应该使用不同的方法吗?
提前致谢