我正在尝试从 phyloseq 对象的两个条件之间的 Beta 多样性箱线图生成箱线图。
我有一个由 vegdist fonction 生成的 Morisita-horn 距离:
vegdist<-vegdist(t(otu_table(physeq_genus_3a)), method="horn")#matrice distance Morisita-horn
vegdist<-as.matrix(vegdist)
现在我有一个矩阵,我想在两个条件下创建一个 Morisita-horn 指数的平均距离箱线图,如下图所示。
我想用 ggplot 做一个简单的箱线图,但因为它是矩阵而不是数据框,所以我做不到。
任何帮助或建议都将受到欢迎。