想知道在基于数据库的科学数据管道 (datajoint) 中如何处理需要手动审查的步骤是否有很好的示例或建议。例如，我们想通过自动化管道处理我们的神经元钙成像数据的预处理和去噪/去混合，但是每个视频和每个单元都需要在输入数据库进行进一步分析之前进行人工审查。处理此类步骤的最佳做法是什么？添加手动表以仅将通过审核的数据添加到下游管道阶段？将手动审查之前的步骤与管道的其余部分分开（在他们自己的架构中？）？谢谢！
问问题
31 次
1 回答
3
自动策展
首先，您可以调用交互式 GUI 作为make需要手动干预的特定表的方法的一部分。它将为人工审查/管理/校正提供计算结果。
单独的手动策展
其次，您可以定义一个手动表来支持手动审查/管理。例如，Curation钙成像元素中的表格遵循以下模式：https ://github.com/datajoint/element-calcium-imaging
于 2021-05-26T18:24:35.610 回答