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我是 R 的新手,我不熟悉 R 中线性混合模型的功能。

我的数据是关于植物生长的,我将害虫作为固定因素(2 个水平),将土壤侵蚀作为一个固定因素(2 个水平),我还想包括它们的相互作用。

试验在三个可能对害虫和土壤侵蚀速率有影响的不同湿度的地点(随机因素)进行。根据植物在叶片形状上的微小差异(嵌套在场地内),植物位于每个场地。

我目前已经用 lme、aov 和 lmer 构建了一些模型,但我不确定哪个是正确的,或者对模型有更好的建议吗?

以下是我提出的模型:

Model1 <- lme(fixed = growth ~ pests*soil, random = ~1|leafshapes, data = plants)` 

我不知道如何在模型中包含“站点”。

测试固定因素(害虫和土壤侵蚀)和随机因素(地点)之间的相互作用:

Model2 <- aov(growth ~ pests*soil + Error(sites/leafshapes), data = plants)

在此处输入图像描述

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