python - 神经影像学“nipype”插件不起作用

Question

我正在做一些事情，这实际上是我的第一次，所以事情对我来说还不是很清楚，我运行了这个代码：

pip install nipype
from nipype import Node, Workflow
from nipype.interfaces.fsl import SliceTimer, MCFLIRT, Smooth

slicetimer = Node(SliceTimer(index_dir=False,
                         interleaved=True,
                         time_repetition=2.5),
              name="slicetimer")

mcflirt = Node(MCFLIRT(mean_vol=True,
                   save_plots=True),
           name="mcflirt")

smooth = Node(Smooth(fwhm=4), name="smooth")

preproc01 = Workflow(name='preproc01', base_dir="dir_path")

preproc01.connect([(slicetimer, mcflirt, [('slice_time_corrected_file', 'in_file')]),
               (mcflirt, smooth, [('out_file', 'in_file')])])

slicetimer.inputs.in_file = "file_path"

preproc01.run('MultiProc')

这是我运行最后一行代码时显示的错误：

"Could not import plugin module: nipype.pipeline.plugins"

还有一个问题：当我尝试运行此代码时：

preproc01.write_graph(graph2use='orig')

这是显示的错误消息：

'No command "dot" found on host. Please check that the corresponding package is installed.'

如果有人知道解决方案，请帮助我。顺便说一句，我从视频系列中这样做，这是链接：https ://www.youtube.com/watch?v=4FVGn8vodkc&t= 4414s Nipype 展示部分。