r - 使用 biomaRt 注释染色体区域

Question

我有一个基因组位置列表如下：

data = data.frame(chr = "chr17", start = 63973115, end = 64437414)
data$query = paste(gsub("chr",'',data$chr),data$start,data$end, sep = ":")

我想知道它们是CDS、5'UTR、3'UTR、内含子、ncRNA、基因间等。为此，我想使用 biomaRt 如下：

library('biomaRt')
mart <- useDataset("hsapiens_gene_ensembl", useMart("ensembl"))

res.genes <- getBM(filters = "chromosomal_region", 
               attributes = c("ensembl_gene_id", "external_gene_name", "description", "gene_biotype"),
               values = data, mart = mart)

总结这些信息的属性是什么？我尝试使用 listAttributes() 函数，但无法确定哪一个是正确的。任何想法 ？