我对让我的样品相互比较有疑问。我对每 2 组(测试和控制)有 3 个重复。我想看看蛋白质是如何变化的。为此,我首先对复制的每一列进行中值集中。然后,我应用了一个统计测试来比较 2 个不同的条件,以找出哪些蛋白质在统计上发生了变化。然后,我将测试组蛋白质划分为控制并取 log2 值。最后,我画了火山图。(因为我不是在比较样本,而是在比较蛋白质,所以我认为应用集中化不是问题)。
你认为我的方法是真的吗?我知道在集中数据时,每个蛋白质水平之间的标准差未标准化为 1。但是,在哪些情况下应该使用中值标准化,在哪些情况下应该使用中值集中化。我遇到过许多研究人员不知道中值标准化和应用中值缩放(将数据的每个复制除以中值)。我对这个概念不太熟悉,对我应该在哪个数据集中使用规范化或标准化有一点疑问。先感谢您。