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当我在本地计算机 RStudio (R 4.0.2) 和 Code Ocean R 4.0.3 上运行相同的 R 代码时，我有两个不同的 UMAP 可视化结果，它们被镜像

[ 在此处输入图像描述]

在此处输入图像描述

我在两种环境中都使用 Seurat 3.2.0 版本，特别是对于 umap 可视化，这里是一行：

DimPlot(MU197PDXThgFiltered, reduction = "umap", label = TRUE, label.size = 6, pt.size = 0.5)

我不能给出一个可重复的例子，但也许有人以前遇到过这个问题？

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我在 Seurat github 上找到了这个：

UMAP 图上点的确切位置可能会跨越不同的计算机和操作系统。我们尽最大努力通过固定随机种子来最小化程序的任何随机性，但是系统之间的一些波动是不可避免的，没有什么可担心的

除了UMAP上的点位置外，簇中的基因表达和其中的细胞数是相同的

于 2021-04-15T04:30:21.030 回答