我一直在关注Ben Bolker 的小插曲,使用 GLMM 预测获得置信区间predict.merMod
,使用模型矩阵手动推导 SE。到目前为止,这对泊松、负二项式和类似模型都有效。但是,我现在正在使用一个二项式模型,其中响应指定为cbind(successes,failures)
. 我对响应量表上的预测感兴趣,但获取置信区间的方法失败了,因为预测输出是成功概率的形式,而不是成功和失败变量的组合。
复制 Ben 在他的小插图中“预测的预测和/或置信度(或预测)区间”的“lme4”部分给出的示例:
library(lme4)
library(ggplot2)
data("Orthodont",package="MEMSS")
fm1 <- lmer(
formula = distance ~ age*Sex + (age|Subject)
, data = Orthodont
)
newdat <- expand.grid(
age=c(8,10,12,14)
, Sex=c("Female","Male")
, distance = 0
)
newdat$distance <- predict(fm1, newdat, type="response", re.form=NA)
mm <- model.matrix(terms(fm1), newdat)
## This is where I am stuck
对于没有提供相关的二项式示例数据集,我深表歉意,但我的问题只是弄清楚如何将此代码调整为二项式模型,因此非常感谢对此的建议(可能使用虚拟对象名称)!论坛上有很多专门针对逻辑回归的帖子,但这无济于事,因为逻辑模型中的响应变量是单个变量。标记为“二项式”的少数帖子处理二项式数据,而不是二项式混合模型的预测。
这是我在执行模型矩阵步骤(虚拟名称)时遇到的错误:
cbind 中的错误(成功,失败):找不到对象“成功”
还有另一种方法可以做到这一点吗?