bioinformatics - 如何将配体与 PyMOL 中的蛋白质结合？

Question

我目前有一个蛋白质是我研究的重点（.pse 文件）和几个配体（.pdb 文件），我希望与该蛋白质结合以查看它们在何处以及如何结合。但是，给定分子没有生物序列，所以我想知道我需要什么命令将配体分子一次与主要蛋白质 1 结合。

当我从主要蛋白质文件中打开配体文件时，我可以看到配体分子，但这是否准确表示了它们实际结合的位置？

谢谢！

Answer 1

对于那些想知道的人，您只需在 PyMOL 中打开您的蛋白质文件（来自 MOE），它就会正确绑定，因为绑定信息存储在来自 MOE 的文件中。