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我有一个问题，我需要在下载后验证巨大的压缩文件（通常每个文件超过 10-20gb）与显然是使用 cksum 生成的参考校验和

（更准确地说：我的 python 脚本需要从 ncbi ftp-server 下载大型压缩文件，该文件应该提供 md5 校验和以验证下载，但只提供了一些不同的未指定的文件哈希/校验和值。经过一些试验和错误我发现这些校验和与 unix 工具的输出相同cksum，它显然会生成 CRC 校验和。因此，为了比较/验证这些，我需要cksum为下载的文件生成等效校验和。）

看来，unix 工具cksum产生的校验和值与假定的等效 unix 工具crc32（或 pythonzlib.crc32()函数，就此而言）完全不同。在谷歌搜索问题时，我无法理解为什么会发生这种情况的解释，特别是因为它们在某些系统上看起来是相同的？所以也许这是因为我在 64 位系统上工作（但是：现在谁没有）？

使用内置的 python 模块，我可以轻松地生成 md5 和 CRC32 校验和，但这些都不等同于 cksum 输出，无论是十进制还是十六进制表示。

我确实在这里找到了一篇关于 stackoverflow 的帖子，指向一个似乎可以解决这个问题的片段。但是，虽然它适用于小文件，A.）我一个字都听不懂，所以我很难适应它，B.）它似乎不适用于大文件。

为了完整起见：这是片段（python3版本）：

#!/usr/bin/env python
import sys

crctab = [ 0x00000000, 0x04c11db7, 0x09823b6e, 0x0d4326d9, 0x130476dc,
        0x17c56b6b, 0x1a864db2, 0x1e475005, 0x2608edb8, 0x22c9f00f,
        0x2f8ad6d6, 0x2b4bcb61, 0x350c9b64, 0x31cd86d3, 0x3c8ea00a,
        0x384fbdbd, 0x4c11db70, 0x48d0c6c7, 0x4593e01e, 0x4152fda9,
        0x5f15adac, 0x5bd4b01b, 0x569796c2, 0x52568b75, 0x6a1936c8,
        0x6ed82b7f, 0x639b0da6, 0x675a1011, 0x791d4014, 0x7ddc5da3,
        0x709f7b7a, 0x745e66cd, 0x9823b6e0, 0x9ce2ab57, 0x91a18d8e,
        0x95609039, 0x8b27c03c, 0x8fe6dd8b, 0x82a5fb52, 0x8664e6e5,
        0xbe2b5b58, 0xbaea46ef, 0xb7a96036, 0xb3687d81, 0xad2f2d84,
        0xa9ee3033, 0xa4ad16ea, 0xa06c0b5d, 0xd4326d90, 0xd0f37027,
        0xddb056fe, 0xd9714b49, 0xc7361b4c, 0xc3f706fb, 0xceb42022,
        0xca753d95, 0xf23a8028, 0xf6fb9d9f, 0xfbb8bb46, 0xff79a6f1,
        0xe13ef6f4, 0xe5ffeb43, 0xe8bccd9a, 0xec7dd02d, 0x34867077,
        0x30476dc0, 0x3d044b19, 0x39c556ae, 0x278206ab, 0x23431b1c,
        0x2e003dc5, 0x2ac12072, 0x128e9dcf, 0x164f8078, 0x1b0ca6a1,
        0x1fcdbb16, 0x018aeb13, 0x054bf6a4, 0x0808d07d, 0x0cc9cdca,
        0x7897ab07, 0x7c56b6b0, 0x71159069, 0x75d48dde, 0x6b93dddb,
        0x6f52c06c, 0x6211e6b5, 0x66d0fb02, 0x5e9f46bf, 0x5a5e5b08,
        0x571d7dd1, 0x53dc6066, 0x4d9b3063, 0x495a2dd4, 0x44190b0d,
        0x40d816ba, 0xaca5c697, 0xa864db20, 0xa527fdf9, 0xa1e6e04e,
        0xbfa1b04b, 0xbb60adfc, 0xb6238b25, 0xb2e29692, 0x8aad2b2f,
        0x8e6c3698, 0x832f1041, 0x87ee0df6, 0x99a95df3, 0x9d684044,
        0x902b669d, 0x94ea7b2a, 0xe0b41de7, 0xe4750050, 0xe9362689,
        0xedf73b3e, 0xf3b06b3b, 0xf771768c, 0xfa325055, 0xfef34de2,
        0xc6bcf05f, 0xc27dede8, 0xcf3ecb31, 0xcbffd686, 0xd5b88683,
        0xd1799b34, 0xdc3abded, 0xd8fba05a, 0x690ce0ee, 0x6dcdfd59,
        0x608edb80, 0x644fc637, 0x7a089632, 0x7ec98b85, 0x738aad5c,
        0x774bb0eb, 0x4f040d56, 0x4bc510e1, 0x46863638, 0x42472b8f,
        0x5c007b8a, 0x58c1663d, 0x558240e4, 0x51435d53, 0x251d3b9e,
        0x21dc2629, 0x2c9f00f0, 0x285e1d47, 0x36194d42, 0x32d850f5,
        0x3f9b762c, 0x3b5a6b9b, 0x0315d626, 0x07d4cb91, 0x0a97ed48,
        0x0e56f0ff, 0x1011a0fa, 0x14d0bd4d, 0x19939b94, 0x1d528623,
        0xf12f560e, 0xf5ee4bb9, 0xf8ad6d60, 0xfc6c70d7, 0xe22b20d2,
        0xe6ea3d65, 0xeba91bbc, 0xef68060b, 0xd727bbb6, 0xd3e6a601,
        0xdea580d8, 0xda649d6f, 0xc423cd6a, 0xc0e2d0dd, 0xcda1f604,
        0xc960ebb3, 0xbd3e8d7e, 0xb9ff90c9, 0xb4bcb610, 0xb07daba7,
        0xae3afba2, 0xaafbe615, 0xa7b8c0cc, 0xa379dd7b, 0x9b3660c6,
        0x9ff77d71, 0x92b45ba8, 0x9675461f, 0x8832161a, 0x8cf30bad,
        0x81b02d74, 0x857130c3, 0x5d8a9099, 0x594b8d2e, 0x5408abf7,
        0x50c9b640, 0x4e8ee645, 0x4a4ffbf2, 0x470cdd2b, 0x43cdc09c,
        0x7b827d21, 0x7f436096, 0x7200464f, 0x76c15bf8, 0x68860bfd,
        0x6c47164a, 0x61043093, 0x65c52d24, 0x119b4be9, 0x155a565e,
        0x18197087, 0x1cd86d30, 0x029f3d35, 0x065e2082, 0x0b1d065b,
        0x0fdc1bec, 0x3793a651, 0x3352bbe6, 0x3e119d3f, 0x3ad08088,
        0x2497d08d, 0x2056cd3a, 0x2d15ebe3, 0x29d4f654, 0xc5a92679,
        0xc1683bce, 0xcc2b1d17, 0xc8ea00a0, 0xd6ad50a5, 0xd26c4d12,
        0xdf2f6bcb, 0xdbee767c, 0xe3a1cbc1, 0xe760d676, 0xea23f0af,
        0xeee2ed18, 0xf0a5bd1d, 0xf464a0aa, 0xf9278673, 0xfde69bc4,
        0x89b8fd09, 0x8d79e0be, 0x803ac667, 0x84fbdbd0, 0x9abc8bd5,
        0x9e7d9662, 0x933eb0bb, 0x97ffad0c, 0xafb010b1, 0xab710d06,
        0xa6322bdf, 0xa2f33668, 0xbcb4666d, 0xb8757bda, 0xb5365d03,
        0xb1f740b4 ]

UNSIGNED = lambda n: n & 0xffffffff

def memcrc(b):
    n = len(b)
    i = c = s = 0
    for c in b:
        tabidx = (s>>24)^c
        s = UNSIGNED((s << 8)) ^ crctab[tabidx]
    while n:
        c = n & 0o0377
        n = n >> 8
        s = UNSIGNED(s << 8) ^ crctab[(s >> 24) ^ c]
    return UNSIGNED(~s)

if __name__ == '__main__':
    fname = sys.argv[-1]
    buffer = open(fname, 'rb').read()
    print("%d\t%d\t%s" %  (memcrc(buffer), len(buffer), fname))

有人可以帮我理解这一点吗？

  • cksum和之间的区别到底有什么问题crc32？
  • 这仅仅是一个基于32位而另一个基于64位的事实吗？
  • 我可以简单地在两者产生的值之间进行转换，如果可以，如何转换？
  • 上述代码段中 crctab 的用途是什么以及转换如何在那里工作？
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2 回答 2

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我不知道你问题的为什么部分。我只能说，标准的伟大之处在于你有很多可供选择。

cksum 由 POSIX 指定使用与您在 zlib、Python、zip 和 gzip 文件等中使用的更常见的 CRC-32 不同的 CRC。CRC-32/CKSUM 具有此规范（来自Greg Cook 的 CRC 目录）：

width=32 poly=0x04c11db7 init=0x00000000 refin=false refout=false xorout=0xffffffff check=0x765e7680 residue=0xc704dd7b name="CRC-32/CKSUM"

更常见的 CRC-32 有这个规范：

width=32 poly=0x04c11db7 init=0xffffffff refin=true refout=true xorout=0xffffffff check=0xcbf43926 residue=0xdebb20e3 name="CRC-32/ISO-HDLC"

我的系统 (macOS) 上的 cksum 实用程序计算 CRC-32/CKSUM，但它也有计算 CRC-32/ISO_HDLC 以及其他两个实际校验和的选项，第一个来自 BSD Unix sum 命令，另一个是第二个来自 AT&T System V Unix sum 命令。

显然不乏 cksum 可能产生的结果。

不，它与 32 位和 64 位系统无关。

不，您不能在值之间进行转换。

该表的目的是通过预先计算每个字节值的 CRC 来加速 CRC 计算。

于 2020-12-04T01:17:22.057 回答
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我尝试将您的代码重构为遵循与标准 Python 类似的 api 的类hashlib：

class crc32:
    def __init__(self):
        self.nchars = 0
        self.crc = 0
    
    def update(self, buf):
        crc = self.crc
        for c in buf:
            crc = crctab[(crc >> 24) ^ c] ^ ((crc << 8) & 0xffffffff)
        self.crc = crc
        self.nchars += len(buf)

    def digest(self):
        crc = self.crc
        n = self.nchars
        while n:
            c = n & 0xff
            crc = crctab[(crc >> 24) ^ c] ^ ((crc << 8) & 0xffffffff)
            n >>= 8
        return UNSIGNED(~crc)

当我试图理解差异时，我已经扩展UNSIGNED以尝试使其更快并重新排序一些语句以更类似于标准zlib 库（如 Python 所使用的）。似乎他们使用不同的多项式来生成表格，但除此之外它是相同的。

上面的代码可以用作：

with open('largefile', 'rb') as fd:
  digest = crc32()
  while buf := fd.read(4096):
    digest.update(buf)
  print(digest.digest())

它为由以下人员创建的文件打印出预期的 1135714720：

echo -n hello world > test.txt

上面的代码应该适用于大文件，但考虑到 Python 的性能，这需要很长时间才能有用。我拥有一个 75MB 的文件大约需要 11 秒，而cksum只需要大约 0.2 秒。您应该能够使用 Cython 来加速它，但这有点繁琐，如果您正在努力使用现有代码，这将是一个相当长的学习曲线！

我有另一场比赛，并获得了cksum与 Cython 类似的性能，代码如下所示：

cdef unsigned int *crctab_c = [
  // copy/paste crctab from above
]

cdef class crc32_c:
    cdef unsigned int crc, nchars

    def __init__(self):
        self.nchars = 0
        self.crc = 0
    
    cdef _update(self, bytes buf):
        cdef unsigned int crc, i, j
        cdef unsigned char c
        crc = self.crc
        for c in buf:
            i = (crc >> 24) ^ c
            j = crc << 8
            crc = crctab_c[i] ^ j
        self.crc = crc
        self.nchars += len(buf)

    def update(self, buf):
        return self._update(buf)

    def digest(self):
        crc = self.crc
        n = self.nchars
        while n:
            c = n & 0xff
            crc = crctab_c[(crc >> 24) ^ c] ^ ((crc << 8) & 0xffffffff)
            n >>= 8
        return (~crc) & 0xffffffff

使用 Cython 编译此代码后，可以以与上一个类类似的方式使用它。性能相当不错：Python 现在需要约 200 毫秒来处理一个 75MiB 的文件，并且与 基本相同cksum，但比仅需要约 80 毫秒的 zlib 慢得多。

于 2020-12-03T19:52:38.463 回答