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我是 R 数据分析的新手,我正在使用自组织图和 Kohonen 包分析 RNAseq 数据,以根据表达趋势对基因进行聚类。我对分析结果非常满意,因为我感兴趣的一些目标基因最终与其他基于基因本体的目标基因位于同一个簇(我们称之为 clusterX)中,可能是有趣的相互作用者。

我使用了六边形网格,所以现在我想检查哪些是 clusterX 的 6 个相邻集群/节点,以查看它们包含哪些基因。

有没有办法知道感兴趣的 clusterX 的相邻集群是什么?

是否可以绘制显示每个集群的 numberID 的地图?与此处附加的 SOM 所做的类似

提前致谢

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