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我之前使用类似下面的代码创建了一个 docker 容器,但我运行了一个基本的 python 脚本来打印“Hello”。我正在尝试在 R 中执行 RNASeq,并在尝试运行代码时不断遇到问题。

这是我的 Dockerfile 中的内容。

FROM debian:stretch-slim

RUN apt-get update \
    && apt-get install -y --no-install-recommends r-base r-base-dev git python3 \
    && apt-get clean

COPY file.R /

在我的终端上,我运行: docker build -t username/python_git_r_hello .

这运行成功,但是当我跟进时: docker run -it username/python_git_r_hello:latest r-base file.R

我收到以下错误:码头工人:

Error response from daemon: OCI runtime create failed: container_linux.go:349: starting container process caused "exec: \"r-base\": executable file not found in $PATH": unknown.
ERRO[0000] error waiting for container: context canceled

请帮忙,我是使用 docker 的新手。

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可执行文件名为R,而不是r-base。跑:

docker run -it username/python_git_r_hello:latest R file.R
于 2020-09-03T23:00:03.430 回答