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我通过 conda 下载了一个名为“beagle”的 java 软件(已经安装了java-jdkjava )。当我运行 Nextflow (NF) 管道(在 NF 的过程中使用软件)时,它说:

无法访问 jarfile beagle.24Aug19.3e8.jar

我激活了 conda env,检查了软件的位置,它在

<conda_env>/share/beagle-5.1_24Aug19.3e8-0/beagle.jar

示例用法是这样的:

java -jar beagle.24Aug19.3e8.jar

所以,我的命令是正确的。我尝试了 NF 过程中的所有组合,例如:

  • java -jar /share/beagle-5.1_24Aug19.3e8-0/beagle.jar
  • java -jar beagle.24Aug19.3e8.jar
  • java -jar beagle.jar
  • java -jar /share/beagle-5.1_24Aug19.3e8-0/beagle.24Aug19.3e8.jar

我错过了什么?为什么无法访问?谢谢!

干杯,

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1 回答 1

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好的,我解决了,但忘了在这里更新。事实上工具的手册说软件的使用应该是:

java -jar beagle.jar

它只适用于“ beagle ”命令。没有删除帖子,因为它可能对其他人有帮助。

干杯,

于 2020-09-03T14:52:34.197 回答