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我已经被这个问题困住了一段时间。我已经在我的 Mac (Catelina) 上安装了一个包 Seurat,但是当调用这个库时,R 将崩溃并显示以下消息:

OMP:错误 #15:正在初始化 libomp.dylib,但发现 libomp.dylib 已经初始化。OMP:提示 这意味着 OpenMP 运行时的多个副本已链接到程序中。这是危险的,因为它会降低性能或导致不正确的结果。最好的办法是确保只有一个 OpenMP 运行时链接到进程中,例如通过避免在任何库中静态链接 OpenMP 运行时。作为一种不安全、不受支持、未记录的解决方法,您可以设置环境变量 KMP_DUPLICATE_LIB_OK=TRUE 以允许程序继续执行,但这可能会导致崩溃或默默地产生不正确的结果。有关详细信息,请参阅http://openmp.llvm.org/ 中止陷阱:6

我四处搜索,这似乎是 MacOS 问题,可能与 conda 有关。但我的机器上没有 conda。

我也酿造了llvm,没用。

请帮我解决这个问题。

谢谢!

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找到了我自己的问题的可能答案。

  1. 删除 ~/Library/r-miniconda
  2. 删除修拉
  3. 安装 Seurat,当要求安装 r-miniconda 时,选择 no

Seurat 包可以成功加载。但仍然不知道 r-miniconda 是否对于与 Seurat 进行进一步分析至关重要。

于 2020-07-23T03:37:41.200 回答