pipeline - 如何将流程输出发送到 Nextflow 中的多个通道？

Question

我正在实施一个 Nextflow 工作流程，其中每个流程都可以提供不同流程下游可能需要的多个输出。

process multiple_outputs {
   input:
   tuple id, input from previous_process

   output:
   tuple id, input_for_a, input_for_b, input_for_a_b into downstream
}

Nextflow 文档指出，operator into 可以使用多个通道，并将通道复制作为一种模式进行推广。

然而，这些选项似乎都没有在流程原语中起作用，并且没有记录多通道输出：

• 在此答案中找到的模式（语法错误）：

  output:
  tuple id, input_for_a, input_for_b, input_for_a_b into { downstream_a; downstream_b }
  // nor these variants:
  //
  // `into { downstream_a, downstream_b }`
  // `into downstream_a, downstream_b`
  // `into tuple a, b`
  

• 将输出重复到重复的通道中（一个通道为空）：

  output:
  tuple id, input_for_a, input_for_a_b into downstream_a
  tuple id, input_for_b, input_for_a_b into downstream_b
  // runs, but cannot find the file in one of the channels
  

在多个通道中使用输出的正确方法是什么？

Answer 1

输出声明应为：

output:
tuple id, input_for_a, input_for_b, input_for_a_b into(downstream_a, downstream_b)

或者，您可能要考虑使用不再具有单通道使用要求的 DLS2。在此处阅读更多相关信息。

Answer 2

答案 b 似乎有效：

output:
tuple id, input_for_a, input_for_a_b into downstream_a
tuple id, input_for_b, input_for_a_b into downstream_b

似乎由于不相关的原因而失败。