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我正在尝试从 Seurat 的聚类功能产生的聚类中创建一个层次聚类树。它们的函数 BuildClusterTree 和 PlotClusterTree 基于 SNN(共享最近邻)算法生成一棵丑陋的树,您无法使用 ggplot2 对其进行操作。我试图弄清楚如何使用其他函数来绘制 Seurat 已经生成的聚类,但我无法弄清楚 R 包如何或哪种效果最好。有人对我有什么建议吗?
为此,我建议使用clustree包