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我正在尝试使用read.codeml_mlc functiontreeio 包中的 mlc 文件(CODEML 程序的输出),如下所示:

library(ggtree)
library(treeio)
tree <- read.codeml_mlc(mlc_file)

但是,我收到以下错误:

strsplit(., split = "[[:space:]]") 中的错误:非字符参数

有谁知道可能出了什么问题?这是来自自由比率分支模型的 PAML 的普通 mlc 输出,我没有修改或更改它。但是,该错误似乎与我的文件有关,因为我已尝试运行教程中的示例(读取随包提供的 mlc 文件)并且工作正常。

换一种说法:strsplit读取 mlc 文件时该函数从何而来,它究竟指的是文件的哪一部分?也许知道这将有助于解决我的问题。

提前感谢您提供的任何帮助!

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