有人可以总结一下 SBML 是什么吗?首字母缩略词代表什么,它的目的是什么?我听说它与系统生物学和计算生物学有关?它用于什么样的计算生物学?
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SBML 是系统生物学标记语言的缩写。它是系统生物学和计算生物学中计算模型的基于 XML 的交换格式。它的核心是通过反应和物种描述基于过程的模型。SBML 是这种计算模型交换的事实标准,它被大量用于编码动力学途径模型(例如代谢途径或信号网络)或基于约束的代谢模型(例如通量平衡分析)。SBML 由核心语言和包组成,这些包通过附加功能扩展了其功能。例如,有一个用于分层模型组合或通量平衡分析的包。有关更多信息,请参阅:
- http://sbml.org/
- 最新语言规范:Level 3 Version 2 (L3V2)
- 描述 SBML 的原始论文:https ://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12611808
于 2020-02-09T21:46:22.177 回答